Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPASTQ9UBP0 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPASTQ9UBP0 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPASTQ9UBP0 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPASTQ9UBP0 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPASTQ9UBP0 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPASTQ9UBP0 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SPASTQ9UBP0 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPASTQ9UBP0 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPASTQ9UBP0 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPASTQ9UBP0 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPASTQ9UBP0 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPASTQ9UBP0 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPASTQ9UBP0 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPASTQ9UBP0 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPASTQ9UBP0 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPASTQ9UBP0 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPASTQ9UBP0 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPASTQ9UBP0 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPASTQ9UBP0 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPASTQ9UBP0 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPASTQ9UBP0 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPASTQ9UBP0 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPASTQ9UBP0 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPASTQ9UBP0 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPASTQ9UBP0 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPASTQ9UBP0 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPASTQ9UBP0 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPASTQ9UBP0 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPASTQ9UBP0 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPASTQ9UBP0 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPASTQ9UBP0 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPASTQ9UBP0 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPASTQ9UBP0 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPASTQ9UBP0 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPASTQ9UBP0 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SPASTQ9UBP0 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPASTQ9UBP0 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPASTQ9UBP0 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPASTQ9UBP0 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPASTQ9UBP0 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPASTQ9UBP0 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPASTQ9UBP0 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPASTQ9UBP0 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPASTQ9UBP0 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPASTQ9UBP0 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPASTQ9UBP0 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPASTQ9UBP0 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPASTQ9UBP0 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPASTQ9UBP0 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPASTQ9UBP0 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPASTQ9UBP0 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPASTQ9UBP0 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPASTQ9UBP0 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPASTQ9UBP0 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPASTQ9UBP0 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPASTQ9UBP0 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SPASTQ9UBP0 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPASTQ9UBP0 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPASTQ9UBP0 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SPASTQ9UBP0 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPASTQ9UBP0 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPASTQ9UBP0 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPASTQ9UBP0 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPASTQ9UBP0 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPASTQ9UBP0 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPASTQ9UBP0 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPASTQ9UBP0 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPASTQ9UBP0 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPASTQ9UBP0 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPASTQ9UBP0 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPASTQ9UBP0 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPASTQ9UBP0 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPASTQ9UBP0 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPASTQ9UBP0 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPASTQ9UBP0 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SPASTQ9UBP0 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPASTQ9UBP0 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPASTQ9UBP0 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPASTQ9UBP0 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPASTQ9UBP0 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPASTQ9UBP0 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPASTQ9UBP0 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPASTQ9UBP0 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPASTQ9UBP0 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPASTQ9UBP0 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPASTQ9UBP0 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPASTQ9UBP0 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPASTQ9UBP0 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPASTQ9UBP0 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPASTQ9UBP0 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPASTQ9UBP0 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SPASTQ9UBP0 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPASTQ9UBP0 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SPASTQ9UBP0 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SPASTQ9UBP0 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPASTQ9UBP0 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPASTQ9UBP0 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPASTQ9UBP0 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPASTQ9UBP0 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms