Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP35Q9P2H5 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP35Q9P2H5 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP35Q9P2H5 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP35Q9P2H5 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP35Q9P2H5 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP35Q9P2H5 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP35Q9P2H5 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP35Q9P2H5 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP35Q9P2H5 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP35Q9P2H5 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP35Q9P2H5 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP35Q9P2H5 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
USP35Q9P2H5 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP35Q9P2H5 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP35Q9P2H5 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP35Q9P2H5 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP35Q9P2H5 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP35Q9P2H5 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP35Q9P2H5 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
USP35Q9P2H5 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
USP35Q9P2H5 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
USP35Q9P2H5 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
USP35Q9P2H5 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
USP35Q9P2H5 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
USP35Q9P2H5 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
USP35Q9P2H5 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
USP35Q9P2H5 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
USP35Q9P2H5 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
USP35Q9P2H5 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
USP35Q9P2H5 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
USP35Q9P2H5 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
USP35Q9P2H5 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
USP35Q9P2H5 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
USP35Q9P2H5 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP35Q9P2H5 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP35Q9P2H5 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP35Q9P2H5 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP35Q9P2H5 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP35Q9P2H5 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP35Q9P2H5 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP35Q9P2H5 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP35Q9P2H5 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP35Q9P2H5 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP35Q9P2H5 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP35Q9P2H5 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP35Q9P2H5 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP35Q9P2H5 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP35Q9P2H5 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP35Q9P2H5 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP35Q9P2H5 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
USP35Q9P2H5 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP35Q9P2H5 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP35Q9P2H5 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP35Q9P2H5 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP35Q9P2H5 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP35Q9P2H5 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP35Q9P2H5 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP35Q9P2H5 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP35Q9P2H5 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP35Q9P2H5 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP35Q9P2H5 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP35Q9P2H5 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
USP35Q9P2H5 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP35Q9P2H5 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP35Q9P2H5 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP35Q9P2H5 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP35Q9P2H5 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP35Q9P2H5 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP35Q9P2H5 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP35Q9P2H5 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP35Q9P2H5 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
USP35Q9P2H5 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
USP35Q9P2H5 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP35Q9P2H5 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP35Q9P2H5 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP35Q9P2H5 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP35Q9P2H5 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP35Q9P2H5 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP35Q9P2H5 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP35Q9P2H5 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP35Q9P2H5 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP35Q9P2H5 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP35Q9P2H5 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP35Q9P2H5 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP35Q9P2H5 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP35Q9P2H5 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP35Q9P2H5 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP35Q9P2H5 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP35Q9P2H5 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP35Q9P2H5 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP35Q9P2H5 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP35Q9P2H5 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP35Q9P2H5 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP35Q9P2H5 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP35Q9P2H5 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP35Q9P2H5 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP35Q9P2H5 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP35Q9P2H5 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP35Q9P2H5 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms