Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXC10Q9NYD6 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXC10Q9NYD6 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXC10Q9NYD6 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXC10Q9NYD6 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXC10Q9NYD6 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXC10Q9NYD6 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXC10Q9NYD6 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXC10Q9NYD6 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXC10Q9NYD6 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXC10Q9NYD6 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXC10Q9NYD6 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXC10Q9NYD6 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXC10Q9NYD6 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXC10Q9NYD6 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXC10Q9NYD6 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXC10Q9NYD6 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXC10Q9NYD6 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXC10Q9NYD6 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXC10Q9NYD6 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXC10Q9NYD6 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXC10Q9NYD6 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXC10Q9NYD6 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXC10Q9NYD6 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXC10Q9NYD6 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXC10Q9NYD6 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXC10Q9NYD6 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXC10Q9NYD6 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXC10Q9NYD6 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXC10Q9NYD6 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXC10Q9NYD6 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXC10Q9NYD6 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXC10Q9NYD6 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXC10Q9NYD6 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXC10Q9NYD6 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXC10Q9NYD6 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXC10Q9NYD6 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXC10Q9NYD6 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXC10Q9NYD6 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXC10Q9NYD6 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXC10Q9NYD6 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXC10Q9NYD6 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXC10Q9NYD6 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXC10Q9NYD6 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXC10Q9NYD6 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXC10Q9NYD6 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXC10Q9NYD6 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXC10Q9NYD6 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXC10Q9NYD6 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXC10Q9NYD6 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXC10Q9NYD6 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXC10Q9NYD6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXC10Q9NYD6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXC10Q9NYD6 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXC10Q9NYD6 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXC10Q9NYD6 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXC10Q9NYD6 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXC10Q9NYD6 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXC10Q9NYD6 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXC10Q9NYD6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXC10Q9NYD6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXC10Q9NYD6 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXC10Q9NYD6 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXC10Q9NYD6 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXC10Q9NYD6 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXC10Q9NYD6 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HOXC10Q9NYD6 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXC10Q9NYD6 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXC10Q9NYD6 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXC10Q9NYD6 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXC10Q9NYD6 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXC10Q9NYD6 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXC10Q9NYD6 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXC10Q9NYD6 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXC10Q9NYD6 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXC10Q9NYD6 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXC10Q9NYD6 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXC10Q9NYD6 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXC10Q9NYD6 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXC10Q9NYD6 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXC10Q9NYD6 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXC10Q9NYD6 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXC10Q9NYD6 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXC10Q9NYD6 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXC10Q9NYD6 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXC10Q9NYD6 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXC10Q9NYD6 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXC10Q9NYD6 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXC10Q9NYD6 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXC10Q9NYD6 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXC10Q9NYD6 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXC10Q9NYD6 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXC10Q9NYD6 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXC10Q9NYD6 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXC10Q9NYD6 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXC10Q9NYD6 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXC10Q9NYD6 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXC10Q9NYD6 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXC10Q9NYD6 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXC10Q9NYD6 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms