Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSI8

SAMSN1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMSN1Q9NSI8 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SAMSN1Q9NSI8 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SAMSN1Q9NSI8 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SAMSN1Q9NSI8 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SAMSN1Q9NSI8 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SAMSN1Q9NSI8 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SAMSN1Q9NSI8 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SAMSN1Q9NSI8 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SAMSN1Q9NSI8 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SAMSN1Q9NSI8 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SAMSN1Q9NSI8 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SAMSN1Q9NSI8 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SAMSN1Q9NSI8 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SAMSN1Q9NSI8 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SAMSN1Q9NSI8 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SAMSN1Q9NSI8 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SAMSN1Q9NSI8 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SAMSN1Q9NSI8 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SAMSN1Q9NSI8 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SAMSN1Q9NSI8 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SAMSN1Q9NSI8 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SAMSN1Q9NSI8 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SAMSN1Q9NSI8 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SAMSN1Q9NSI8 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SAMSN1Q9NSI8 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SAMSN1Q9NSI8 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SAMSN1Q9NSI8 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SAMSN1Q9NSI8 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SAMSN1Q9NSI8 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SAMSN1Q9NSI8 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SAMSN1Q9NSI8 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SAMSN1Q9NSI8 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SAMSN1Q9NSI8 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SAMSN1Q9NSI8 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SAMSN1Q9NSI8 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SAMSN1Q9NSI8 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SAMSN1Q9NSI8 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SAMSN1Q9NSI8 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SAMSN1Q9NSI8 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SAMSN1Q9NSI8 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SAMSN1Q9NSI8 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SAMSN1Q9NSI8 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SAMSN1Q9NSI8 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SAMSN1Q9NSI8 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SAMSN1Q9NSI8 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SAMSN1Q9NSI8 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SAMSN1Q9NSI8 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SAMSN1Q9NSI8 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SAMSN1Q9NSI8 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SAMSN1Q9NSI8 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SAMSN1Q9NSI8 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SAMSN1Q9NSI8 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SAMSN1Q9NSI8 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SAMSN1Q9NSI8 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SAMSN1Q9NSI8 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SAMSN1Q9NSI8 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SAMSN1Q9NSI8 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SAMSN1Q9NSI8 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SAMSN1Q9NSI8 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SAMSN1Q9NSI8 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SAMSN1Q9NSI8 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SAMSN1Q9NSI8 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SAMSN1Q9NSI8 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SAMSN1Q9NSI8 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SAMSN1Q9NSI8 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SAMSN1Q9NSI8 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SAMSN1Q9NSI8 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SAMSN1Q9NSI8 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SAMSN1Q9NSI8 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SAMSN1Q9NSI8 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SAMSN1Q9NSI8 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SAMSN1Q9NSI8 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SAMSN1Q9NSI8 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SAMSN1Q9NSI8 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SAMSN1Q9NSI8 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SAMSN1Q9NSI8 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SAMSN1Q9NSI8 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SAMSN1Q9NSI8 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SAMSN1Q9NSI8 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SAMSN1Q9NSI8 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SAMSN1Q9NSI8 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SAMSN1Q9NSI8 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SAMSN1Q9NSI8 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SAMSN1Q9NSI8 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SAMSN1Q9NSI8 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SAMSN1Q9NSI8 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SAMSN1Q9NSI8 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SAMSN1Q9NSI8 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SAMSN1Q9NSI8 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SAMSN1Q9NSI8 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SAMSN1Q9NSI8 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SAMSN1Q9NSI8 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SAMSN1Q9NSI8 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SAMSN1Q9NSI8 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SAMSN1Q9NSI8 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SAMSN1Q9NSI8 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SAMSN1Q9NSI8 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SAMSN1Q9NSI8 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SAMSN1Q9NSI8 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SAMSN1Q9NSI8 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms