Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP79

VTA1, Vacuolar protein sorting-associated protein VTA1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTA1Q9NP79 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
VTA1Q9NP79 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
VTA1Q9NP79 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
VTA1Q9NP79 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
VTA1Q9NP79 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
VTA1Q9NP79 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
VTA1Q9NP79 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
VTA1Q9NP79 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VTA1Q9NP79 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VTA1Q9NP79 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VTA1Q9NP79 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VTA1Q9NP79 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VTA1Q9NP79 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VTA1Q9NP79 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VTA1Q9NP79 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VTA1Q9NP79 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VTA1Q9NP79 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VTA1Q9NP79 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VTA1Q9NP79 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VTA1Q9NP79 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
VTA1Q9NP79 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VTA1Q9NP79 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VTA1Q9NP79 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VTA1Q9NP79 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VTA1Q9NP79 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VTA1Q9NP79 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VTA1Q9NP79 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VTA1Q9NP79 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VTA1Q9NP79 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VTA1Q9NP79 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VTA1Q9NP79 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VTA1Q9NP79 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VTA1Q9NP79 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VTA1Q9NP79 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VTA1Q9NP79 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VTA1Q9NP79 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
VTA1Q9NP79 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
VTA1Q9NP79 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
VTA1Q9NP79 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VTA1Q9NP79 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VTA1Q9NP79 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VTA1Q9NP79 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VTA1Q9NP79 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VTA1Q9NP79 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VTA1Q9NP79 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VTA1Q9NP79 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VTA1Q9NP79 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VTA1Q9NP79 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VTA1Q9NP79 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VTA1Q9NP79 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VTA1Q9NP79 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VTA1Q9NP79 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VTA1Q9NP79 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VTA1Q9NP79 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VTA1Q9NP79 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VTA1Q9NP79 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VTA1Q9NP79 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VTA1Q9NP79 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VTA1Q9NP79 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VTA1Q9NP79 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
VTA1Q9NP79 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VTA1Q9NP79 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VTA1Q9NP79 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VTA1Q9NP79 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VTA1Q9NP79 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VTA1Q9NP79 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VTA1Q9NP79 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VTA1Q9NP79 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VTA1Q9NP79 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VTA1Q9NP79 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VTA1Q9NP79 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VTA1Q9NP79 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VTA1Q9NP79 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VTA1Q9NP79 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VTA1Q9NP79 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VTA1Q9NP79 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VTA1Q9NP79 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VTA1Q9NP79 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VTA1Q9NP79 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VTA1Q9NP79 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VTA1Q9NP79 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VTA1Q9NP79 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VTA1Q9NP79 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VTA1Q9NP79 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VTA1Q9NP79 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VTA1Q9NP79 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VTA1Q9NP79 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VTA1Q9NP79 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VTA1Q9NP79 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VTA1Q9NP79 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VTA1Q9NP79 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VTA1Q9NP79 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VTA1Q9NP79 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VTA1Q9NP79 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VTA1Q9NP79 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VTA1Q9NP79 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VTA1Q9NP79 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VTA1Q9NP79 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VTA1Q9NP79 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VTA1Q9NP79 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms