Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZCCHC17Q9NP64 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZCCHC17Q9NP64 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZCCHC17Q9NP64 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZCCHC17Q9NP64 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZCCHC17Q9NP64 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZCCHC17Q9NP64 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZCCHC17Q9NP64 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZCCHC17Q9NP64 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZCCHC17Q9NP64 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZCCHC17Q9NP64 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZCCHC17Q9NP64 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZCCHC17Q9NP64 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZCCHC17Q9NP64 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZCCHC17Q9NP64 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZCCHC17Q9NP64 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZCCHC17Q9NP64 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZCCHC17Q9NP64 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZCCHC17Q9NP64 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZCCHC17Q9NP64 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZCCHC17Q9NP64 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZCCHC17Q9NP64 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZCCHC17Q9NP64 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZCCHC17Q9NP64 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZCCHC17Q9NP64 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZCCHC17Q9NP64 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZCCHC17Q9NP64 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZCCHC17Q9NP64 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZCCHC17Q9NP64 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZCCHC17Q9NP64 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZCCHC17Q9NP64 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZCCHC17Q9NP64 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZCCHC17Q9NP64 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZCCHC17Q9NP64 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZCCHC17Q9NP64 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZCCHC17Q9NP64 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZCCHC17Q9NP64 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZCCHC17Q9NP64 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZCCHC17Q9NP64 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZCCHC17Q9NP64 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZCCHC17Q9NP64 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZCCHC17Q9NP64 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZCCHC17Q9NP64 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZCCHC17Q9NP64 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZCCHC17Q9NP64 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZCCHC17Q9NP64 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZCCHC17Q9NP64 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZCCHC17Q9NP64 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZCCHC17Q9NP64 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZCCHC17Q9NP64 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZCCHC17Q9NP64 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ZCCHC17Q9NP64 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ZCCHC17Q9NP64 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZCCHC17Q9NP64 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZCCHC17Q9NP64 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZCCHC17Q9NP64 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZCCHC17Q9NP64 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZCCHC17Q9NP64 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZCCHC17Q9NP64 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZCCHC17Q9NP64 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZCCHC17Q9NP64 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ZCCHC17Q9NP64 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ZCCHC17Q9NP64 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZCCHC17Q9NP64 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZCCHC17Q9NP64 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZCCHC17Q9NP64 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZCCHC17Q9NP64 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZCCHC17Q9NP64 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZCCHC17Q9NP64 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZCCHC17Q9NP64 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZCCHC17Q9NP64 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZCCHC17Q9NP64 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZCCHC17Q9NP64 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZCCHC17Q9NP64 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZCCHC17Q9NP64 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ZCCHC17Q9NP64 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZCCHC17Q9NP64 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZCCHC17Q9NP64 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ZCCHC17Q9NP64 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZCCHC17Q9NP64 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ZCCHC17Q9NP64 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZCCHC17Q9NP64 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ZCCHC17Q9NP64 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZCCHC17Q9NP64 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZCCHC17Q9NP64 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZCCHC17Q9NP64 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZCCHC17Q9NP64 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZCCHC17Q9NP64 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZCCHC17Q9NP64 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZCCHC17Q9NP64 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZCCHC17Q9NP64 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZCCHC17Q9NP64 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZCCHC17Q9NP64 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZCCHC17Q9NP64 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZCCHC17Q9NP64 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZCCHC17Q9NP64 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZCCHC17Q9NP64 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZCCHC17Q9NP64 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ZCCHC17Q9NP64 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZCCHC17Q9NP64 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms