Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4L4

SENP3, Sentrin-specific protease 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3Q9H4L4 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SENP3Q9H4L4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SENP3Q9H4L4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SENP3Q9H4L4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SENP3Q9H4L4 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SENP3Q9H4L4 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SENP3Q9H4L4 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SENP3Q9H4L4 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SENP3Q9H4L4 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SENP3Q9H4L4 RPS20P25-201ENST00000412447 352 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
SENP3Q9H4L4 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SENP3Q9H4L4 AC099063.1-201ENST00000437128 324 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SENP3Q9H4L4 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SENP3Q9H4L4 DEFT1P-201ENST00000453425 496 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
SENP3Q9H4L4 GTPBP8-204ENST00000467752 686 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SENP3Q9H4L4 AL591767.1-201ENST00000557160 568 ntTSL 4 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SENP3Q9H4L4 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SENP3Q9H4L4 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SENP3Q9H4L4 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
SENP3Q9H4L4 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SENP3Q9H4L4 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SENP3Q9H4L4 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SENP3Q9H4L4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.39
SENP3Q9H4L4 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
SENP3Q9H4L4 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
SENP3Q9H4L4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
SENP3Q9H4L4 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
SENP3Q9H4L4 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
SENP3Q9H4L4 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
SENP3Q9H4L4 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
SENP3Q9H4L4 AC020611.2-201ENST00000535594 671 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
SENP3Q9H4L4 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
SENP3Q9H4L4 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
SENP3Q9H4L4 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
SENP3Q9H4L4 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SENP3Q9H4L4 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SENP3Q9H4L4 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SENP3Q9H4L4 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SENP3Q9H4L4 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SENP3Q9H4L4 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SENP3Q9H4L4 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SENP3Q9H4L4 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SENP3Q9H4L4 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SENP3Q9H4L4 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SENP3Q9H4L4 FAM9B-203ENST00000428477 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SENP3Q9H4L4 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
SENP3Q9H4L4 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
SENP3Q9H4L4 AC138907.10-201ENST00000623708 983 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
SENP3Q9H4L4 AC009039.2-201ENST00000624524 529 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
SENP3Q9H4L4 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SENP3Q9H4L4 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SENP3Q9H4L4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SENP3Q9H4L4 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SENP3Q9H4L4 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SENP3Q9H4L4 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SENP3Q9H4L4 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SENP3Q9H4L4 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SENP3Q9H4L4 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SENP3Q9H4L4 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SENP3Q9H4L4 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
SENP3Q9H4L4 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SENP3Q9H4L4 TMEM154-204ENST00000613578 486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SENP3Q9H4L4 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SENP3Q9H4L4 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SENP3Q9H4L4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SENP3Q9H4L4 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SENP3Q9H4L4 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SENP3Q9H4L4 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SENP3Q9H4L4 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SENP3Q9H4L4 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SENP3Q9H4L4 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SENP3Q9H4L4 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SENP3Q9H4L4 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SENP3Q9H4L4 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SENP3Q9H4L4 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
SENP3Q9H4L4 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SENP3Q9H4L4 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SENP3Q9H4L4 PRELID3BP7-201ENST00000503606 469 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
SENP3Q9H4L4 AC092451.2-201ENST00000538746 658 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
SENP3Q9H4L4 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SENP3Q9H4L4 AC008750.5-201ENST00000595500 473 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SENP3Q9H4L4 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SENP3Q9H4L4 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SENP3Q9H4L4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SENP3Q9H4L4 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SENP3Q9H4L4 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SENP3Q9H4L4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SENP3Q9H4L4 COA1-202ENST00000310564 1085 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SENP3Q9H4L4 GIMAP7-201ENST00000313543 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SENP3Q9H4L4 H3F3A-203ENST00000366815 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SENP3Q9H4L4 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SENP3Q9H4L4 AC009495.2-201ENST00000457108 506 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SENP3Q9H4L4 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SENP3Q9H4L4 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SENP3Q9H4L4 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SENP3Q9H4L4 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SENP3Q9H4L4 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SENP3Q9H4L4 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SENP3Q9H4L4 ZNF92P2-201ENST00000600543 1059 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
SENP3Q9H4L4 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms