Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0F6

SHARPIN, Sharpin, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHARPINQ9H0F6 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SHARPINQ9H0F6 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SHARPINQ9H0F6 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SHARPINQ9H0F6 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SHARPINQ9H0F6 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SHARPINQ9H0F6 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SHARPINQ9H0F6 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SHARPINQ9H0F6 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SHARPINQ9H0F6 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SHARPINQ9H0F6 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SHARPINQ9H0F6 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SHARPINQ9H0F6 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SHARPINQ9H0F6 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
SHARPINQ9H0F6 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SHARPINQ9H0F6 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SHARPINQ9H0F6 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SHARPINQ9H0F6 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SHARPINQ9H0F6 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SHARPINQ9H0F6 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SHARPINQ9H0F6 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SHARPINQ9H0F6 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SHARPINQ9H0F6 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SHARPINQ9H0F6 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SHARPINQ9H0F6 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SHARPINQ9H0F6 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SHARPINQ9H0F6 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SHARPINQ9H0F6 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SHARPINQ9H0F6 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SHARPINQ9H0F6 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SHARPINQ9H0F6 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SHARPINQ9H0F6 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SHARPINQ9H0F6 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SHARPINQ9H0F6 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SHARPINQ9H0F6 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SHARPINQ9H0F6 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SHARPINQ9H0F6 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SHARPINQ9H0F6 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SHARPINQ9H0F6 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SHARPINQ9H0F6 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SHARPINQ9H0F6 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SHARPINQ9H0F6 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SHARPINQ9H0F6 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SHARPINQ9H0F6 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SHARPINQ9H0F6 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SHARPINQ9H0F6 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SHARPINQ9H0F6 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SHARPINQ9H0F6 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SHARPINQ9H0F6 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SHARPINQ9H0F6 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SHARPINQ9H0F6 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SHARPINQ9H0F6 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SHARPINQ9H0F6 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SHARPINQ9H0F6 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SHARPINQ9H0F6 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SHARPINQ9H0F6 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SHARPINQ9H0F6 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SHARPINQ9H0F6 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SHARPINQ9H0F6 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SHARPINQ9H0F6 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SHARPINQ9H0F6 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SHARPINQ9H0F6 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SHARPINQ9H0F6 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SHARPINQ9H0F6 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SHARPINQ9H0F6 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SHARPINQ9H0F6 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SHARPINQ9H0F6 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SHARPINQ9H0F6 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SHARPINQ9H0F6 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SHARPINQ9H0F6 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SHARPINQ9H0F6 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SHARPINQ9H0F6 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SHARPINQ9H0F6 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SHARPINQ9H0F6 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SHARPINQ9H0F6 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SHARPINQ9H0F6 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SHARPINQ9H0F6 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SHARPINQ9H0F6 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SHARPINQ9H0F6 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SHARPINQ9H0F6 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SHARPINQ9H0F6 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SHARPINQ9H0F6 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SHARPINQ9H0F6 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SHARPINQ9H0F6 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SHARPINQ9H0F6 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SHARPINQ9H0F6 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SHARPINQ9H0F6 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SHARPINQ9H0F6 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SHARPINQ9H0F6 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SHARPINQ9H0F6 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SHARPINQ9H0F6 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SHARPINQ9H0F6 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SHARPINQ9H0F6 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SHARPINQ9H0F6 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SHARPINQ9H0F6 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SHARPINQ9H0F6 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SHARPINQ9H0F6 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SHARPINQ9H0F6 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SHARPINQ9H0F6 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SHARPINQ9H0F6 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SHARPINQ9H0F6 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms