Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RBBP8Q99708 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RBBP8Q99708 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RBBP8Q99708 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RBBP8Q99708 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RBBP8Q99708 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RBBP8Q99708 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RBBP8Q99708 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RBBP8Q99708 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RBBP8Q99708 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RBBP8Q99708 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RBBP8Q99708 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RBBP8Q99708 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RBBP8Q99708 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RBBP8Q99708 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RBBP8Q99708 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RBBP8Q99708 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RBBP8Q99708 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RBBP8Q99708 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
RBBP8Q99708 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
RBBP8Q99708 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RBBP8Q99708 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RBBP8Q99708 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RBBP8Q99708 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RBBP8Q99708 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RBBP8Q99708 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RBBP8Q99708 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RBBP8Q99708 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RBBP8Q99708 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RBBP8Q99708 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RBBP8Q99708 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RBBP8Q99708 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RBBP8Q99708 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RBBP8Q99708 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RBBP8Q99708 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RBBP8Q99708 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RBBP8Q99708 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RBBP8Q99708 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RBBP8Q99708 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RBBP8Q99708 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RBBP8Q99708 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RBBP8Q99708 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RBBP8Q99708 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RBBP8Q99708 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RBBP8Q99708 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
RBBP8Q99708 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RBBP8Q99708 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RBBP8Q99708 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RBBP8Q99708 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RBBP8Q99708 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RBBP8Q99708 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RBBP8Q99708 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RBBP8Q99708 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RBBP8Q99708 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RBBP8Q99708 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RBBP8Q99708 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RBBP8Q99708 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
RBBP8Q99708 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
RBBP8Q99708 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RBBP8Q99708 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RBBP8Q99708 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RBBP8Q99708 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RBBP8Q99708 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RBBP8Q99708 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RBBP8Q99708 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RBBP8Q99708 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RBBP8Q99708 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RBBP8Q99708 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RBBP8Q99708 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RBBP8Q99708 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RBBP8Q99708 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RBBP8Q99708 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RBBP8Q99708 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RBBP8Q99708 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RBBP8Q99708 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RBBP8Q99708 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RBBP8Q99708 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RBBP8Q99708 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RBBP8Q99708 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RBBP8Q99708 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RBBP8Q99708 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RBBP8Q99708 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RBBP8Q99708 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RBBP8Q99708 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RBBP8Q99708 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RBBP8Q99708 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RBBP8Q99708 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RBBP8Q99708 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RBBP8Q99708 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RBBP8Q99708 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RBBP8Q99708 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RBBP8Q99708 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RBBP8Q99708 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RBBP8Q99708 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RBBP8Q99708 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RBBP8Q99708 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RBBP8Q99708 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RBBP8Q99708 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RBBP8Q99708 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RBBP8Q99708 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms