Protein–RNA interactions for Protein: Q96T23

RSF1, Remodeling and spacing factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSF1Q96T23 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
RSF1Q96T23 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
RSF1Q96T23 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC36.86■■■■□ 3.49
RSF1Q96T23 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
RSF1Q96T23 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.86■■■■□ 3.49
RSF1Q96T23 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
RSF1Q96T23 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC36.86■■■■□ 3.49
RSF1Q96T23 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.86■■■■□ 3.49
RSF1Q96T23 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
RSF1Q96T23 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC36.86■■■■□ 3.49
RSF1Q96T23 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
RSF1Q96T23 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
RSF1Q96T23 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
RSF1Q96T23 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
RSF1Q96T23 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
RSF1Q96T23 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
RSF1Q96T23 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
RSF1Q96T23 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
RSF1Q96T23 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
RSF1Q96T23 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.85■■■■□ 3.49
RSF1Q96T23 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
RSF1Q96T23 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC36.85■■■■□ 3.49
RSF1Q96T23 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
RSF1Q96T23 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
RSF1Q96T23 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC36.85■■■■□ 3.49
RSF1Q96T23 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
RSF1Q96T23 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
RSF1Q96T23 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC36.84■■■■□ 3.49
RSF1Q96T23 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
RSF1Q96T23 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC36.84■■■■□ 3.49
RSF1Q96T23 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
RSF1Q96T23 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
RSF1Q96T23 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
RSF1Q96T23 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
RSF1Q96T23 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC36.84■■■■□ 3.49
RSF1Q96T23 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.84■■■■□ 3.49
RSF1Q96T23 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC36.84■■■■□ 3.49
RSF1Q96T23 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
RSF1Q96T23 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
RSF1Q96T23 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
RSF1Q96T23 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
RSF1Q96T23 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
RSF1Q96T23 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
RSF1Q96T23 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
RSF1Q96T23 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
RSF1Q96T23 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
RSF1Q96T23 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
RSF1Q96T23 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
RSF1Q96T23 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
RSF1Q96T23 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
RSF1Q96T23 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC36.82■■■■□ 3.49
RSF1Q96T23 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.49
RSF1Q96T23 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
RSF1Q96T23 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
RSF1Q96T23 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC36.82■■■■□ 3.49
RSF1Q96T23 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
RSF1Q96T23 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.48
RSF1Q96T23 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.48
RSF1Q96T23 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC36.82■■■■□ 3.48
RSF1Q96T23 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.48
RSF1Q96T23 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
RSF1Q96T23 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
RSF1Q96T23 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
RSF1Q96T23 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC36.81■■■■□ 3.48
RSF1Q96T23 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
RSF1Q96T23 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
RSF1Q96T23 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
RSF1Q96T23 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
RSF1Q96T23 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC36.81■■■■□ 3.48
RSF1Q96T23 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
RSF1Q96T23 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
RSF1Q96T23 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
RSF1Q96T23 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
RSF1Q96T23 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC36.81■■■■□ 3.48
RSF1Q96T23 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
RSF1Q96T23 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
RSF1Q96T23 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
RSF1Q96T23 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
RSF1Q96T23 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
RSF1Q96T23 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
RSF1Q96T23 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
RSF1Q96T23 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
RSF1Q96T23 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
RSF1Q96T23 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
RSF1Q96T23 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
RSF1Q96T23 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
RSF1Q96T23 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
RSF1Q96T23 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
RSF1Q96T23 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
RSF1Q96T23 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
RSF1Q96T23 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
RSF1Q96T23 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
RSF1Q96T23 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
RSF1Q96T23 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
RSF1Q96T23 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC36.79■■■■□ 3.48
RSF1Q96T23 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC36.79■■■■□ 3.48
RSF1Q96T23 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
RSF1Q96T23 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.79■■■■□ 3.48
RSF1Q96T23 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC36.79■■■■□ 3.48
RSF1Q96T23 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC36.79■■■■□ 3.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms