Protein–RNA interactions for Protein: Q96M43

NBPF4, Neuroblastoma breakpoint family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF4Q96M43 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
NBPF4Q96M43 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NBPF4Q96M43 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NBPF4Q96M43 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NBPF4Q96M43 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NBPF4Q96M43 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NBPF4Q96M43 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NBPF4Q96M43 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NBPF4Q96M43 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NBPF4Q96M43 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NBPF4Q96M43 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NBPF4Q96M43 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NBPF4Q96M43 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NBPF4Q96M43 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NBPF4Q96M43 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NBPF4Q96M43 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NBPF4Q96M43 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
NBPF4Q96M43 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NBPF4Q96M43 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NBPF4Q96M43 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NBPF4Q96M43 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NBPF4Q96M43 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NBPF4Q96M43 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NBPF4Q96M43 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NBPF4Q96M43 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NBPF4Q96M43 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NBPF4Q96M43 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NBPF4Q96M43 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NBPF4Q96M43 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NBPF4Q96M43 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
NBPF4Q96M43 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
NBPF4Q96M43 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NBPF4Q96M43 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NBPF4Q96M43 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NBPF4Q96M43 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NBPF4Q96M43 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NBPF4Q96M43 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
NBPF4Q96M43 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NBPF4Q96M43 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NBPF4Q96M43 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NBPF4Q96M43 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NBPF4Q96M43 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NBPF4Q96M43 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NBPF4Q96M43 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NBPF4Q96M43 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NBPF4Q96M43 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NBPF4Q96M43 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NBPF4Q96M43 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NBPF4Q96M43 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NBPF4Q96M43 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NBPF4Q96M43 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NBPF4Q96M43 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
NBPF4Q96M43 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
NBPF4Q96M43 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
NBPF4Q96M43 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NBPF4Q96M43 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NBPF4Q96M43 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NBPF4Q96M43 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NBPF4Q96M43 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NBPF4Q96M43 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NBPF4Q96M43 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NBPF4Q96M43 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NBPF4Q96M43 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NBPF4Q96M43 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NBPF4Q96M43 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NBPF4Q96M43 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NBPF4Q96M43 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NBPF4Q96M43 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NBPF4Q96M43 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NBPF4Q96M43 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NBPF4Q96M43 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NBPF4Q96M43 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NBPF4Q96M43 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NBPF4Q96M43 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NBPF4Q96M43 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NBPF4Q96M43 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NBPF4Q96M43 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NBPF4Q96M43 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NBPF4Q96M43 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NBPF4Q96M43 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
NBPF4Q96M43 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NBPF4Q96M43 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NBPF4Q96M43 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NBPF4Q96M43 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NBPF4Q96M43 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NBPF4Q96M43 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NBPF4Q96M43 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NBPF4Q96M43 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NBPF4Q96M43 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NBPF4Q96M43 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NBPF4Q96M43 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
NBPF4Q96M43 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NBPF4Q96M43 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NBPF4Q96M43 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NBPF4Q96M43 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NBPF4Q96M43 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NBPF4Q96M43 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NBPF4Q96M43 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NBPF4Q96M43 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NBPF4Q96M43 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms