Protein–RNA interactions for Protein: Q96FC9

DDX11, ATP-dependent DNA helicase DDX11, humanhuman

Predictions only

Length 970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX11Q96FC9 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDX11Q96FC9 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDX11Q96FC9 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDX11Q96FC9 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDX11Q96FC9 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDX11Q96FC9 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDX11Q96FC9 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDX11Q96FC9 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDX11Q96FC9 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDX11Q96FC9 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDX11Q96FC9 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDX11Q96FC9 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX11Q96FC9 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX11Q96FC9 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX11Q96FC9 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX11Q96FC9 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX11Q96FC9 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX11Q96FC9 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX11Q96FC9 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX11Q96FC9 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX11Q96FC9 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX11Q96FC9 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX11Q96FC9 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX11Q96FC9 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX11Q96FC9 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX11Q96FC9 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX11Q96FC9 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX11Q96FC9 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX11Q96FC9 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX11Q96FC9 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DDX11Q96FC9 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DDX11Q96FC9 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DDX11Q96FC9 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
DDX11Q96FC9 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
DDX11Q96FC9 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DDX11Q96FC9 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DDX11Q96FC9 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DDX11Q96FC9 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DDX11Q96FC9 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DDX11Q96FC9 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DDX11Q96FC9 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DDX11Q96FC9 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DDX11Q96FC9 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDX11Q96FC9 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
DDX11Q96FC9 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDX11Q96FC9 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDX11Q96FC9 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDX11Q96FC9 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDX11Q96FC9 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDX11Q96FC9 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDX11Q96FC9 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDX11Q96FC9 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDX11Q96FC9 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
DDX11Q96FC9 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDX11Q96FC9 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDX11Q96FC9 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDX11Q96FC9 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDX11Q96FC9 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDX11Q96FC9 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDX11Q96FC9 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDX11Q96FC9 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDX11Q96FC9 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDX11Q96FC9 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDX11Q96FC9 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DDX11Q96FC9 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DDX11Q96FC9 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DDX11Q96FC9 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DDX11Q96FC9 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DDX11Q96FC9 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DDX11Q96FC9 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DDX11Q96FC9 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DDX11Q96FC9 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DDX11Q96FC9 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DDX11Q96FC9 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DDX11Q96FC9 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DDX11Q96FC9 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DDX11Q96FC9 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DDX11Q96FC9 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DDX11Q96FC9 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDX11Q96FC9 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDX11Q96FC9 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDX11Q96FC9 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDX11Q96FC9 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDX11Q96FC9 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDX11Q96FC9 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDX11Q96FC9 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDX11Q96FC9 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDX11Q96FC9 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDX11Q96FC9 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDX11Q96FC9 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDX11Q96FC9 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDX11Q96FC9 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
DDX11Q96FC9 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
DDX11Q96FC9 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDX11Q96FC9 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDX11Q96FC9 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDX11Q96FC9 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDX11Q96FC9 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDX11Q96FC9 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDX11Q96FC9 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms