Protein–RNA interactions for Protein: Q96EL3

MRPL53, 39S ribosomal protein L53, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL53Q96EL3 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MRPL53Q96EL3 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRPL53Q96EL3 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRPL53Q96EL3 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRPL53Q96EL3 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRPL53Q96EL3 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRPL53Q96EL3 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRPL53Q96EL3 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRPL53Q96EL3 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRPL53Q96EL3 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRPL53Q96EL3 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRPL53Q96EL3 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRPL53Q96EL3 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRPL53Q96EL3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRPL53Q96EL3 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRPL53Q96EL3 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRPL53Q96EL3 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRPL53Q96EL3 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRPL53Q96EL3 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRPL53Q96EL3 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRPL53Q96EL3 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRPL53Q96EL3 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRPL53Q96EL3 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRPL53Q96EL3 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRPL53Q96EL3 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MRPL53Q96EL3 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRPL53Q96EL3 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRPL53Q96EL3 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRPL53Q96EL3 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRPL53Q96EL3 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRPL53Q96EL3 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRPL53Q96EL3 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRPL53Q96EL3 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRPL53Q96EL3 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRPL53Q96EL3 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MRPL53Q96EL3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MRPL53Q96EL3 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MRPL53Q96EL3 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRPL53Q96EL3 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MRPL53Q96EL3 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MRPL53Q96EL3 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRPL53Q96EL3 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRPL53Q96EL3 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRPL53Q96EL3 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRPL53Q96EL3 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRPL53Q96EL3 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRPL53Q96EL3 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPL53Q96EL3 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPL53Q96EL3 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPL53Q96EL3 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPL53Q96EL3 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPL53Q96EL3 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPL53Q96EL3 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPL53Q96EL3 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPL53Q96EL3 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPL53Q96EL3 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPL53Q96EL3 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPL53Q96EL3 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPL53Q96EL3 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPL53Q96EL3 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPL53Q96EL3 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPL53Q96EL3 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPL53Q96EL3 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPL53Q96EL3 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPL53Q96EL3 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPL53Q96EL3 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPL53Q96EL3 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPL53Q96EL3 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPL53Q96EL3 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPL53Q96EL3 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPL53Q96EL3 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPL53Q96EL3 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPL53Q96EL3 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPL53Q96EL3 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPL53Q96EL3 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPL53Q96EL3 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRPL53Q96EL3 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRPL53Q96EL3 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRPL53Q96EL3 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRPL53Q96EL3 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRPL53Q96EL3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms