Protein–RNA interactions for Protein: Q96AJ9

VTI1A, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1AQ96AJ9 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VTI1AQ96AJ9 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VTI1AQ96AJ9 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VTI1AQ96AJ9 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VTI1AQ96AJ9 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VTI1AQ96AJ9 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VTI1AQ96AJ9 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VTI1AQ96AJ9 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VTI1AQ96AJ9 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
VTI1AQ96AJ9 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VTI1AQ96AJ9 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VTI1AQ96AJ9 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VTI1AQ96AJ9 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VTI1AQ96AJ9 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VTI1AQ96AJ9 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VTI1AQ96AJ9 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VTI1AQ96AJ9 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VTI1AQ96AJ9 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VTI1AQ96AJ9 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VTI1AQ96AJ9 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VTI1AQ96AJ9 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VTI1AQ96AJ9 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VTI1AQ96AJ9 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VTI1AQ96AJ9 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VTI1AQ96AJ9 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VTI1AQ96AJ9 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VTI1AQ96AJ9 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VTI1AQ96AJ9 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VTI1AQ96AJ9 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VTI1AQ96AJ9 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VTI1AQ96AJ9 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VTI1AQ96AJ9 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VTI1AQ96AJ9 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VTI1AQ96AJ9 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VTI1AQ96AJ9 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VTI1AQ96AJ9 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VTI1AQ96AJ9 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VTI1AQ96AJ9 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VTI1AQ96AJ9 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VTI1AQ96AJ9 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VTI1AQ96AJ9 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VTI1AQ96AJ9 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VTI1AQ96AJ9 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VTI1AQ96AJ9 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VTI1AQ96AJ9 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VTI1AQ96AJ9 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
VTI1AQ96AJ9 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VTI1AQ96AJ9 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VTI1AQ96AJ9 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VTI1AQ96AJ9 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VTI1AQ96AJ9 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VTI1AQ96AJ9 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VTI1AQ96AJ9 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VTI1AQ96AJ9 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VTI1AQ96AJ9 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VTI1AQ96AJ9 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VTI1AQ96AJ9 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VTI1AQ96AJ9 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
VTI1AQ96AJ9 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VTI1AQ96AJ9 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VTI1AQ96AJ9 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
VTI1AQ96AJ9 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VTI1AQ96AJ9 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VTI1AQ96AJ9 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VTI1AQ96AJ9 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VTI1AQ96AJ9 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VTI1AQ96AJ9 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VTI1AQ96AJ9 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VTI1AQ96AJ9 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VTI1AQ96AJ9 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VTI1AQ96AJ9 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VTI1AQ96AJ9 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VTI1AQ96AJ9 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VTI1AQ96AJ9 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VTI1AQ96AJ9 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VTI1AQ96AJ9 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VTI1AQ96AJ9 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VTI1AQ96AJ9 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VTI1AQ96AJ9 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VTI1AQ96AJ9 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
VTI1AQ96AJ9 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VTI1AQ96AJ9 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VTI1AQ96AJ9 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VTI1AQ96AJ9 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
VTI1AQ96AJ9 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
VTI1AQ96AJ9 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
VTI1AQ96AJ9 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VTI1AQ96AJ9 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VTI1AQ96AJ9 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VTI1AQ96AJ9 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VTI1AQ96AJ9 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VTI1AQ96AJ9 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
VTI1AQ96AJ9 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VTI1AQ96AJ9 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VTI1AQ96AJ9 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VTI1AQ96AJ9 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VTI1AQ96AJ9 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VTI1AQ96AJ9 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VTI1AQ96AJ9 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VTI1AQ96AJ9 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms