Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVB4

SLC9A9, Sodium/hydrogen exchanger 9, humanhuman

Predictions only

Length 645 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A9Q8IVB4 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC9A9Q8IVB4 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC9A9Q8IVB4 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC9A9Q8IVB4 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC9A9Q8IVB4 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC9A9Q8IVB4 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC9A9Q8IVB4 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC9A9Q8IVB4 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC9A9Q8IVB4 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC9A9Q8IVB4 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC9A9Q8IVB4 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC9A9Q8IVB4 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC9A9Q8IVB4 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC9A9Q8IVB4 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC9A9Q8IVB4 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC9A9Q8IVB4 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC9A9Q8IVB4 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC9A9Q8IVB4 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC9A9Q8IVB4 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC9A9Q8IVB4 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC9A9Q8IVB4 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC9A9Q8IVB4 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC9A9Q8IVB4 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC9A9Q8IVB4 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC9A9Q8IVB4 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC9A9Q8IVB4 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC9A9Q8IVB4 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC9A9Q8IVB4 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC9A9Q8IVB4 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC9A9Q8IVB4 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC9A9Q8IVB4 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC9A9Q8IVB4 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC9A9Q8IVB4 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC9A9Q8IVB4 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC9A9Q8IVB4 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC9A9Q8IVB4 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC9A9Q8IVB4 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC9A9Q8IVB4 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC9A9Q8IVB4 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC9A9Q8IVB4 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC9A9Q8IVB4 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC9A9Q8IVB4 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC9A9Q8IVB4 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC9A9Q8IVB4 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC9A9Q8IVB4 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC9A9Q8IVB4 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC9A9Q8IVB4 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC9A9Q8IVB4 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC9A9Q8IVB4 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC9A9Q8IVB4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC9A9Q8IVB4 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC9A9Q8IVB4 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC9A9Q8IVB4 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC9A9Q8IVB4 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC9A9Q8IVB4 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC9A9Q8IVB4 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC9A9Q8IVB4 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC9A9Q8IVB4 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC9A9Q8IVB4 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC9A9Q8IVB4 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC9A9Q8IVB4 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC9A9Q8IVB4 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC9A9Q8IVB4 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC9A9Q8IVB4 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC9A9Q8IVB4 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC9A9Q8IVB4 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC9A9Q8IVB4 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC9A9Q8IVB4 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC9A9Q8IVB4 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC9A9Q8IVB4 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC9A9Q8IVB4 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC9A9Q8IVB4 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC9A9Q8IVB4 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC9A9Q8IVB4 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC9A9Q8IVB4 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC9A9Q8IVB4 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC9A9Q8IVB4 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC9A9Q8IVB4 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC9A9Q8IVB4 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC9A9Q8IVB4 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC9A9Q8IVB4 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC9A9Q8IVB4 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC9A9Q8IVB4 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC9A9Q8IVB4 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC9A9Q8IVB4 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC9A9Q8IVB4 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC9A9Q8IVB4 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC9A9Q8IVB4 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC9A9Q8IVB4 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC9A9Q8IVB4 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC9A9Q8IVB4 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC9A9Q8IVB4 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC9A9Q8IVB4 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC9A9Q8IVB4 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC9A9Q8IVB4 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC9A9Q8IVB4 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC9A9Q8IVB4 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC9A9Q8IVB4 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC9A9Q8IVB4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC9A9Q8IVB4 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms