Protein–RNA interactions for Protein: Q86WP2

GPBP1, Vasculin, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPBP1Q86WP2 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPBP1Q86WP2 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPBP1Q86WP2 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPBP1Q86WP2 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPBP1Q86WP2 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPBP1Q86WP2 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPBP1Q86WP2 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPBP1Q86WP2 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPBP1Q86WP2 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPBP1Q86WP2 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPBP1Q86WP2 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPBP1Q86WP2 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPBP1Q86WP2 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPBP1Q86WP2 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPBP1Q86WP2 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPBP1Q86WP2 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPBP1Q86WP2 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPBP1Q86WP2 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPBP1Q86WP2 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPBP1Q86WP2 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPBP1Q86WP2 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPBP1Q86WP2 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPBP1Q86WP2 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPBP1Q86WP2 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPBP1Q86WP2 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPBP1Q86WP2 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPBP1Q86WP2 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPBP1Q86WP2 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPBP1Q86WP2 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPBP1Q86WP2 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPBP1Q86WP2 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GPBP1Q86WP2 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GPBP1Q86WP2 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GPBP1Q86WP2 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GPBP1Q86WP2 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GPBP1Q86WP2 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GPBP1Q86WP2 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GPBP1Q86WP2 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GPBP1Q86WP2 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
GPBP1Q86WP2 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
GPBP1Q86WP2 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GPBP1Q86WP2 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
GPBP1Q86WP2 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPBP1Q86WP2 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPBP1Q86WP2 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPBP1Q86WP2 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPBP1Q86WP2 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPBP1Q86WP2 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPBP1Q86WP2 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPBP1Q86WP2 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPBP1Q86WP2 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPBP1Q86WP2 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPBP1Q86WP2 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GPBP1Q86WP2 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPBP1Q86WP2 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPBP1Q86WP2 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPBP1Q86WP2 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPBP1Q86WP2 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPBP1Q86WP2 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPBP1Q86WP2 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPBP1Q86WP2 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPBP1Q86WP2 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPBP1Q86WP2 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPBP1Q86WP2 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPBP1Q86WP2 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPBP1Q86WP2 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPBP1Q86WP2 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPBP1Q86WP2 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPBP1Q86WP2 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPBP1Q86WP2 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPBP1Q86WP2 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPBP1Q86WP2 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPBP1Q86WP2 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPBP1Q86WP2 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPBP1Q86WP2 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPBP1Q86WP2 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPBP1Q86WP2 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPBP1Q86WP2 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPBP1Q86WP2 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPBP1Q86WP2 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPBP1Q86WP2 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPBP1Q86WP2 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPBP1Q86WP2 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPBP1Q86WP2 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPBP1Q86WP2 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPBP1Q86WP2 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPBP1Q86WP2 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPBP1Q86WP2 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPBP1Q86WP2 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPBP1Q86WP2 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPBP1Q86WP2 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GPBP1Q86WP2 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPBP1Q86WP2 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GPBP1Q86WP2 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPBP1Q86WP2 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GPBP1Q86WP2 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPBP1Q86WP2 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPBP1Q86WP2 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPBP1Q86WP2 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPBP1Q86WP2 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms