Protein–RNA interactions for Protein: Q7L0J3

SV2A, Synaptic vesicle glycoprotein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SV2AQ7L0J3 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SV2AQ7L0J3 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SV2AQ7L0J3 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SV2AQ7L0J3 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SV2AQ7L0J3 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SV2AQ7L0J3 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SV2AQ7L0J3 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SV2AQ7L0J3 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SV2AQ7L0J3 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SV2AQ7L0J3 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SV2AQ7L0J3 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SV2AQ7L0J3 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SV2AQ7L0J3 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SV2AQ7L0J3 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SV2AQ7L0J3 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SV2AQ7L0J3 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SV2AQ7L0J3 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SV2AQ7L0J3 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SV2AQ7L0J3 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SV2AQ7L0J3 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SV2AQ7L0J3 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SV2AQ7L0J3 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SV2AQ7L0J3 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SV2AQ7L0J3 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SV2AQ7L0J3 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SV2AQ7L0J3 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SV2AQ7L0J3 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SV2AQ7L0J3 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SV2AQ7L0J3 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SV2AQ7L0J3 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SV2AQ7L0J3 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SV2AQ7L0J3 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SV2AQ7L0J3 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SV2AQ7L0J3 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SV2AQ7L0J3 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SV2AQ7L0J3 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SV2AQ7L0J3 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SV2AQ7L0J3 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SV2AQ7L0J3 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SV2AQ7L0J3 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SV2AQ7L0J3 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SV2AQ7L0J3 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SV2AQ7L0J3 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SV2AQ7L0J3 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SV2AQ7L0J3 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SV2AQ7L0J3 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SV2AQ7L0J3 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SV2AQ7L0J3 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SV2AQ7L0J3 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SV2AQ7L0J3 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SV2AQ7L0J3 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SV2AQ7L0J3 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SV2AQ7L0J3 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SV2AQ7L0J3 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SV2AQ7L0J3 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SV2AQ7L0J3 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SV2AQ7L0J3 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SV2AQ7L0J3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SV2AQ7L0J3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SV2AQ7L0J3 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SV2AQ7L0J3 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SV2AQ7L0J3 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SV2AQ7L0J3 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SV2AQ7L0J3 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SV2AQ7L0J3 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SV2AQ7L0J3 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SV2AQ7L0J3 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SV2AQ7L0J3 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SV2AQ7L0J3 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SV2AQ7L0J3 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SV2AQ7L0J3 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SV2AQ7L0J3 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SV2AQ7L0J3 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SV2AQ7L0J3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SV2AQ7L0J3 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SV2AQ7L0J3 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SV2AQ7L0J3 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SV2AQ7L0J3 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SV2AQ7L0J3 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SV2AQ7L0J3 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SV2AQ7L0J3 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SV2AQ7L0J3 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SV2AQ7L0J3 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SV2AQ7L0J3 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SV2AQ7L0J3 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SV2AQ7L0J3 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SV2AQ7L0J3 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SV2AQ7L0J3 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SV2AQ7L0J3 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SV2AQ7L0J3 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SV2AQ7L0J3 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SV2AQ7L0J3 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SV2AQ7L0J3 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SV2AQ7L0J3 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SV2AQ7L0J3 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SV2AQ7L0J3 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SV2AQ7L0J3 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SV2AQ7L0J3 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SV2AQ7L0J3 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SV2AQ7L0J3 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms