Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT52

FAM43B, Protein FAM43B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM43BQ6ZT52 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM43BQ6ZT52 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM43BQ6ZT52 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM43BQ6ZT52 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM43BQ6ZT52 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM43BQ6ZT52 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM43BQ6ZT52 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM43BQ6ZT52 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM43BQ6ZT52 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM43BQ6ZT52 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM43BQ6ZT52 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM43BQ6ZT52 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM43BQ6ZT52 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM43BQ6ZT52 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM43BQ6ZT52 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM43BQ6ZT52 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM43BQ6ZT52 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM43BQ6ZT52 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM43BQ6ZT52 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM43BQ6ZT52 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM43BQ6ZT52 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM43BQ6ZT52 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM43BQ6ZT52 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM43BQ6ZT52 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM43BQ6ZT52 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM43BQ6ZT52 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM43BQ6ZT52 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM43BQ6ZT52 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM43BQ6ZT52 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM43BQ6ZT52 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM43BQ6ZT52 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM43BQ6ZT52 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM43BQ6ZT52 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM43BQ6ZT52 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM43BQ6ZT52 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM43BQ6ZT52 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM43BQ6ZT52 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM43BQ6ZT52 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM43BQ6ZT52 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM43BQ6ZT52 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM43BQ6ZT52 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM43BQ6ZT52 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM43BQ6ZT52 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM43BQ6ZT52 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM43BQ6ZT52 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM43BQ6ZT52 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM43BQ6ZT52 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM43BQ6ZT52 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM43BQ6ZT52 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM43BQ6ZT52 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
FAM43BQ6ZT52 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM43BQ6ZT52 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM43BQ6ZT52 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM43BQ6ZT52 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM43BQ6ZT52 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM43BQ6ZT52 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM43BQ6ZT52 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM43BQ6ZT52 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM43BQ6ZT52 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM43BQ6ZT52 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM43BQ6ZT52 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM43BQ6ZT52 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM43BQ6ZT52 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM43BQ6ZT52 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM43BQ6ZT52 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM43BQ6ZT52 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM43BQ6ZT52 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM43BQ6ZT52 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM43BQ6ZT52 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM43BQ6ZT52 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM43BQ6ZT52 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM43BQ6ZT52 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM43BQ6ZT52 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM43BQ6ZT52 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM43BQ6ZT52 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM43BQ6ZT52 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM43BQ6ZT52 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM43BQ6ZT52 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM43BQ6ZT52 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM43BQ6ZT52 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM43BQ6ZT52 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM43BQ6ZT52 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM43BQ6ZT52 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM43BQ6ZT52 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM43BQ6ZT52 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM43BQ6ZT52 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM43BQ6ZT52 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM43BQ6ZT52 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM43BQ6ZT52 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM43BQ6ZT52 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM43BQ6ZT52 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM43BQ6ZT52 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM43BQ6ZT52 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM43BQ6ZT52 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM43BQ6ZT52 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM43BQ6ZT52 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM43BQ6ZT52 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM43BQ6ZT52 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM43BQ6ZT52 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM43BQ6ZT52 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms