Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS4

CCDC129, Coiled-coil domain-containing protein 129, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC129Q6ZRS4 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC129Q6ZRS4 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC129Q6ZRS4 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC129Q6ZRS4 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC129Q6ZRS4 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC129Q6ZRS4 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC129Q6ZRS4 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC129Q6ZRS4 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC129Q6ZRS4 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC129Q6ZRS4 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC129Q6ZRS4 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC129Q6ZRS4 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC129Q6ZRS4 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC129Q6ZRS4 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC129Q6ZRS4 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC129Q6ZRS4 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC129Q6ZRS4 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC129Q6ZRS4 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC129Q6ZRS4 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC129Q6ZRS4 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC129Q6ZRS4 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC129Q6ZRS4 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC129Q6ZRS4 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC129Q6ZRS4 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC129Q6ZRS4 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC129Q6ZRS4 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC129Q6ZRS4 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC129Q6ZRS4 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC129Q6ZRS4 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC129Q6ZRS4 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC129Q6ZRS4 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC129Q6ZRS4 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC129Q6ZRS4 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC129Q6ZRS4 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC129Q6ZRS4 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC129Q6ZRS4 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC129Q6ZRS4 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC129Q6ZRS4 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC129Q6ZRS4 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC129Q6ZRS4 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC129Q6ZRS4 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC129Q6ZRS4 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC129Q6ZRS4 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC129Q6ZRS4 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC129Q6ZRS4 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC129Q6ZRS4 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC129Q6ZRS4 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC129Q6ZRS4 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC129Q6ZRS4 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC129Q6ZRS4 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC129Q6ZRS4 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC129Q6ZRS4 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC129Q6ZRS4 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC129Q6ZRS4 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC129Q6ZRS4 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC129Q6ZRS4 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC129Q6ZRS4 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC129Q6ZRS4 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC129Q6ZRS4 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC129Q6ZRS4 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC129Q6ZRS4 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC129Q6ZRS4 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC129Q6ZRS4 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC129Q6ZRS4 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC129Q6ZRS4 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC129Q6ZRS4 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC129Q6ZRS4 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC129Q6ZRS4 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC129Q6ZRS4 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC129Q6ZRS4 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC129Q6ZRS4 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC129Q6ZRS4 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC129Q6ZRS4 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC129Q6ZRS4 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC129Q6ZRS4 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC129Q6ZRS4 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC129Q6ZRS4 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC129Q6ZRS4 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC129Q6ZRS4 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC129Q6ZRS4 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC129Q6ZRS4 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC129Q6ZRS4 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC129Q6ZRS4 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC129Q6ZRS4 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC129Q6ZRS4 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC129Q6ZRS4 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC129Q6ZRS4 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC129Q6ZRS4 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC129Q6ZRS4 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC129Q6ZRS4 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC129Q6ZRS4 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC129Q6ZRS4 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC129Q6ZRS4 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC129Q6ZRS4 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC129Q6ZRS4 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC129Q6ZRS4 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC129Q6ZRS4 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC129Q6ZRS4 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC129Q6ZRS4 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC129Q6ZRS4 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms