Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C16orf54Q6UWD8 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms