Protein–RNA interactions for Protein: Q6UVM3

KCNT2, Potassium channel subfamily T member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT2Q6UVM3 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNT2Q6UVM3 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNT2Q6UVM3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNT2Q6UVM3 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNT2Q6UVM3 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNT2Q6UVM3 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNT2Q6UVM3 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNT2Q6UVM3 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNT2Q6UVM3 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNT2Q6UVM3 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNT2Q6UVM3 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNT2Q6UVM3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNT2Q6UVM3 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNT2Q6UVM3 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNT2Q6UVM3 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNT2Q6UVM3 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNT2Q6UVM3 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNT2Q6UVM3 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNT2Q6UVM3 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNT2Q6UVM3 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNT2Q6UVM3 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNT2Q6UVM3 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNT2Q6UVM3 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNT2Q6UVM3 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNT2Q6UVM3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNT2Q6UVM3 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNT2Q6UVM3 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNT2Q6UVM3 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNT2Q6UVM3 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNT2Q6UVM3 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNT2Q6UVM3 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNT2Q6UVM3 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNT2Q6UVM3 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNT2Q6UVM3 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNT2Q6UVM3 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNT2Q6UVM3 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNT2Q6UVM3 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNT2Q6UVM3 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNT2Q6UVM3 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNT2Q6UVM3 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNT2Q6UVM3 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNT2Q6UVM3 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNT2Q6UVM3 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNT2Q6UVM3 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNT2Q6UVM3 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNT2Q6UVM3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNT2Q6UVM3 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNT2Q6UVM3 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNT2Q6UVM3 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNT2Q6UVM3 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNT2Q6UVM3 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNT2Q6UVM3 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNT2Q6UVM3 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNT2Q6UVM3 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNT2Q6UVM3 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNT2Q6UVM3 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNT2Q6UVM3 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNT2Q6UVM3 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNT2Q6UVM3 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNT2Q6UVM3 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KCNT2Q6UVM3 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KCNT2Q6UVM3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KCNT2Q6UVM3 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
KCNT2Q6UVM3 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KCNT2Q6UVM3 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNT2Q6UVM3 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNT2Q6UVM3 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNT2Q6UVM3 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNT2Q6UVM3 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNT2Q6UVM3 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNT2Q6UVM3 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNT2Q6UVM3 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNT2Q6UVM3 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNT2Q6UVM3 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNT2Q6UVM3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNT2Q6UVM3 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNT2Q6UVM3 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNT2Q6UVM3 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNT2Q6UVM3 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNT2Q6UVM3 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNT2Q6UVM3 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNT2Q6UVM3 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNT2Q6UVM3 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNT2Q6UVM3 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNT2Q6UVM3 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNT2Q6UVM3 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNT2Q6UVM3 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNT2Q6UVM3 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNT2Q6UVM3 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNT2Q6UVM3 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNT2Q6UVM3 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNT2Q6UVM3 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNT2Q6UVM3 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNT2Q6UVM3 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNT2Q6UVM3 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNT2Q6UVM3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNT2Q6UVM3 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNT2Q6UVM3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNT2Q6UVM3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNT2Q6UVM3 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms