Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV0

NBPF1, Neuroblastoma breakpoint family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF1Q3BBV0 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
NBPF1Q3BBV0 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
NBPF1Q3BBV0 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NBPF1Q3BBV0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NBPF1Q3BBV0 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NBPF1Q3BBV0 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NBPF1Q3BBV0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NBPF1Q3BBV0 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NBPF1Q3BBV0 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NBPF1Q3BBV0 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NBPF1Q3BBV0 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NBPF1Q3BBV0 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
NBPF1Q3BBV0 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NBPF1Q3BBV0 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NBPF1Q3BBV0 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
NBPF1Q3BBV0 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NBPF1Q3BBV0 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NBPF1Q3BBV0 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NBPF1Q3BBV0 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NBPF1Q3BBV0 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NBPF1Q3BBV0 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NBPF1Q3BBV0 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NBPF1Q3BBV0 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NBPF1Q3BBV0 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NBPF1Q3BBV0 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NBPF1Q3BBV0 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NBPF1Q3BBV0 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NBPF1Q3BBV0 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NBPF1Q3BBV0 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NBPF1Q3BBV0 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NBPF1Q3BBV0 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NBPF1Q3BBV0 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NBPF1Q3BBV0 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NBPF1Q3BBV0 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NBPF1Q3BBV0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NBPF1Q3BBV0 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NBPF1Q3BBV0 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NBPF1Q3BBV0 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NBPF1Q3BBV0 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
NBPF1Q3BBV0 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
NBPF1Q3BBV0 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NBPF1Q3BBV0 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
NBPF1Q3BBV0 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NBPF1Q3BBV0 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NBPF1Q3BBV0 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NBPF1Q3BBV0 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NBPF1Q3BBV0 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NBPF1Q3BBV0 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
NBPF1Q3BBV0 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NBPF1Q3BBV0 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
NBPF1Q3BBV0 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NBPF1Q3BBV0 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NBPF1Q3BBV0 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NBPF1Q3BBV0 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NBPF1Q3BBV0 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NBPF1Q3BBV0 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NBPF1Q3BBV0 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NBPF1Q3BBV0 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NBPF1Q3BBV0 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NBPF1Q3BBV0 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NBPF1Q3BBV0 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
NBPF1Q3BBV0 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
NBPF1Q3BBV0 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC29■■■□□ 2.23
NBPF1Q3BBV0 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
NBPF1Q3BBV0 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC29■■■□□ 2.23
NBPF1Q3BBV0 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
NBPF1Q3BBV0 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC29■■■□□ 2.23
NBPF1Q3BBV0 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NBPF1Q3BBV0 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NBPF1Q3BBV0 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NBPF1Q3BBV0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NBPF1Q3BBV0 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
NBPF1Q3BBV0 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
NBPF1Q3BBV0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NBPF1Q3BBV0 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NBPF1Q3BBV0 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NBPF1Q3BBV0 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NBPF1Q3BBV0 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NBPF1Q3BBV0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NBPF1Q3BBV0 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NBPF1Q3BBV0 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NBPF1Q3BBV0 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NBPF1Q3BBV0 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
NBPF1Q3BBV0 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NBPF1Q3BBV0 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NBPF1Q3BBV0 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NBPF1Q3BBV0 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NBPF1Q3BBV0 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NBPF1Q3BBV0 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NBPF1Q3BBV0 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NBPF1Q3BBV0 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NBPF1Q3BBV0 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NBPF1Q3BBV0 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NBPF1Q3BBV0 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
NBPF1Q3BBV0 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NBPF1Q3BBV0 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NBPF1Q3BBV0 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NBPF1Q3BBV0 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NBPF1Q3BBV0 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NBPF1Q3BBV0 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms