Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRIK4Q16099 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRIK4Q16099 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRIK4Q16099 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIK4Q16099 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIK4Q16099 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIK4Q16099 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIK4Q16099 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIK4Q16099 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIK4Q16099 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIK4Q16099 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIK4Q16099 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIK4Q16099 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIK4Q16099 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIK4Q16099 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIK4Q16099 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIK4Q16099 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIK4Q16099 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIK4Q16099 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIK4Q16099 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIK4Q16099 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIK4Q16099 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIK4Q16099 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIK4Q16099 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIK4Q16099 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIK4Q16099 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIK4Q16099 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIK4Q16099 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIK4Q16099 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIK4Q16099 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIK4Q16099 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIK4Q16099 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIK4Q16099 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIK4Q16099 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIK4Q16099 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIK4Q16099 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIK4Q16099 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIK4Q16099 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIK4Q16099 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIK4Q16099 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIK4Q16099 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIK4Q16099 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIK4Q16099 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIK4Q16099 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIK4Q16099 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIK4Q16099 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIK4Q16099 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIK4Q16099 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIK4Q16099 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIK4Q16099 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIK4Q16099 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIK4Q16099 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIK4Q16099 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIK4Q16099 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIK4Q16099 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIK4Q16099 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIK4Q16099 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIK4Q16099 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GRIK4Q16099 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GRIK4Q16099 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GRIK4Q16099 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GRIK4Q16099 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GRIK4Q16099 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GRIK4Q16099 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GRIK4Q16099 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GRIK4Q16099 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GRIK4Q16099 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GRIK4Q16099 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GRIK4Q16099 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GRIK4Q16099 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GRIK4Q16099 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GRIK4Q16099 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GRIK4Q16099 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIK4Q16099 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIK4Q16099 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIK4Q16099 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIK4Q16099 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIK4Q16099 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIK4Q16099 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIK4Q16099 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIK4Q16099 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIK4Q16099 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIK4Q16099 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIK4Q16099 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIK4Q16099 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIK4Q16099 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIK4Q16099 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIK4Q16099 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIK4Q16099 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIK4Q16099 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIK4Q16099 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIK4Q16099 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIK4Q16099 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIK4Q16099 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIK4Q16099 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIK4Q16099 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIK4Q16099 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIK4Q16099 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIK4Q16099 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIK4Q16099 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms