Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TAF1AQ15573 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TAF1AQ15573 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TAF1AQ15573 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TAF1AQ15573 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TAF1AQ15573 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TAF1AQ15573 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TAF1AQ15573 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TAF1AQ15573 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TAF1AQ15573 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TAF1AQ15573 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TAF1AQ15573 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TAF1AQ15573 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TAF1AQ15573 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TAF1AQ15573 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TAF1AQ15573 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TAF1AQ15573 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TAF1AQ15573 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TAF1AQ15573 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TAF1AQ15573 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
TAF1AQ15573 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TAF1AQ15573 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TAF1AQ15573 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TAF1AQ15573 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
TAF1AQ15573 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
TAF1AQ15573 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TAF1AQ15573 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TAF1AQ15573 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TAF1AQ15573 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
TAF1AQ15573 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TAF1AQ15573 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TAF1AQ15573 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TAF1AQ15573 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TAF1AQ15573 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TAF1AQ15573 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TAF1AQ15573 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TAF1AQ15573 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TAF1AQ15573 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TAF1AQ15573 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TAF1AQ15573 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TAF1AQ15573 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TAF1AQ15573 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TAF1AQ15573 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TAF1AQ15573 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TAF1AQ15573 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TAF1AQ15573 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TAF1AQ15573 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TAF1AQ15573 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TAF1AQ15573 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TAF1AQ15573 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TAF1AQ15573 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TAF1AQ15573 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TAF1AQ15573 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TAF1AQ15573 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TAF1AQ15573 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TAF1AQ15573 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TAF1AQ15573 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TAF1AQ15573 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TAF1AQ15573 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TAF1AQ15573 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TAF1AQ15573 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TAF1AQ15573 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TAF1AQ15573 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TAF1AQ15573 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TAF1AQ15573 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TAF1AQ15573 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TAF1AQ15573 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TAF1AQ15573 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TAF1AQ15573 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TAF1AQ15573 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TAF1AQ15573 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TAF1AQ15573 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TAF1AQ15573 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TAF1AQ15573 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TAF1AQ15573 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TAF1AQ15573 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TAF1AQ15573 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TAF1AQ15573 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TAF1AQ15573 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TAF1AQ15573 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TAF1AQ15573 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TAF1AQ15573 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TAF1AQ15573 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TAF1AQ15573 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TAF1AQ15573 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TAF1AQ15573 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TAF1AQ15573 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TAF1AQ15573 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TAF1AQ15573 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TAF1AQ15573 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TAF1AQ15573 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TAF1AQ15573 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TAF1AQ15573 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TAF1AQ15573 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TAF1AQ15573 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TAF1AQ15573 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TAF1AQ15573 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TAF1AQ15573 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TAF1AQ15573 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TAF1AQ15573 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
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