Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TCIRG1Q13488 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TCIRG1Q13488 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TCIRG1Q13488 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TCIRG1Q13488 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TCIRG1Q13488 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
TCIRG1Q13488 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TCIRG1Q13488 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TCIRG1Q13488 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TCIRG1Q13488 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TCIRG1Q13488 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TCIRG1Q13488 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TCIRG1Q13488 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TCIRG1Q13488 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TCIRG1Q13488 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TCIRG1Q13488 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
TCIRG1Q13488 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TCIRG1Q13488 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TCIRG1Q13488 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TCIRG1Q13488 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TCIRG1Q13488 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TCIRG1Q13488 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TCIRG1Q13488 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TCIRG1Q13488 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TCIRG1Q13488 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TCIRG1Q13488 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TCIRG1Q13488 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TCIRG1Q13488 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TCIRG1Q13488 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TCIRG1Q13488 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TCIRG1Q13488 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TCIRG1Q13488 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TCIRG1Q13488 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TCIRG1Q13488 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TCIRG1Q13488 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TCIRG1Q13488 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TCIRG1Q13488 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TCIRG1Q13488 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TCIRG1Q13488 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TCIRG1Q13488 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TCIRG1Q13488 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TCIRG1Q13488 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TCIRG1Q13488 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TCIRG1Q13488 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TCIRG1Q13488 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TCIRG1Q13488 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
TCIRG1Q13488 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
TCIRG1Q13488 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TCIRG1Q13488 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TCIRG1Q13488 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TCIRG1Q13488 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TCIRG1Q13488 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TCIRG1Q13488 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TCIRG1Q13488 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TCIRG1Q13488 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TCIRG1Q13488 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TCIRG1Q13488 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TCIRG1Q13488 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TCIRG1Q13488 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TCIRG1Q13488 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TCIRG1Q13488 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TCIRG1Q13488 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TCIRG1Q13488 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TCIRG1Q13488 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TCIRG1Q13488 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TCIRG1Q13488 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TCIRG1Q13488 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TCIRG1Q13488 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TCIRG1Q13488 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TCIRG1Q13488 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TCIRG1Q13488 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TCIRG1Q13488 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
TCIRG1Q13488 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TCIRG1Q13488 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TCIRG1Q13488 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TCIRG1Q13488 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TCIRG1Q13488 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TCIRG1Q13488 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TCIRG1Q13488 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TCIRG1Q13488 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TCIRG1Q13488 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TCIRG1Q13488 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TCIRG1Q13488 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TCIRG1Q13488 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TCIRG1Q13488 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TCIRG1Q13488 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TCIRG1Q13488 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TCIRG1Q13488 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TCIRG1Q13488 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TCIRG1Q13488 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TCIRG1Q13488 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TCIRG1Q13488 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TCIRG1Q13488 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TCIRG1Q13488 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TCIRG1Q13488 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TCIRG1Q13488 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TCIRG1Q13488 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TCIRG1Q13488 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TCIRG1Q13488 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TCIRG1Q13488 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
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