Protein–RNA interactions for Protein: Q08622

GEP3, Genetic interactor of prohibitins 3, mitochondrial, yeastyeast

Predictions only

Length 556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GEP3Q08622 YHR214C-EYHR214C-E 300 nt2.84□□□□□ -1.95
GEP3Q08622 tW(UCA)QtW(UCA)Q 74 nt2.84□□□□□ -1.95
GEP3Q08622 YAR070CYAR070C 300 nt2.84□□□□□ -1.95
GEP3Q08622 snR13snR13 124 nt2.84□□□□□ -1.95
GEP3Q08622 YPL039WYPL039W 951 nt2.84□□□□□ -1.95
GEP3Q08622 FLO9YAL063C 3969 nt2.84□□□□□ -1.96
GEP3Q08622 MSD1YPL104W 1977 nt2.83□□□□□ -1.96
GEP3Q08622 CDC26YFR036W 375 nt2.83□□□□□ -1.96
GEP3Q08622 YHR214W-AYHR214W-A 486 nt2.83□□□□□ -1.96
GEP3Q08622 YJL202CYJL202C 348 nt2.83□□□□□ -1.96
GEP3Q08622 AIM26YKL037W 357 nt2.83□□□□□ -1.96
GEP3Q08622 SHE2YKL130C 741 nt2.83□□□□□ -1.96
GEP3Q08622 RPL22AYLR061W 366 nt2.83□□□□□ -1.96
GEP3Q08622 YAR068WYAR068W 486 nt2.83□□□□□ -1.96
GEP3Q08622 SHH3YMR118C 591 nt2.83□□□□□ -1.96
GEP3Q08622 TIR2YOR010C 756 nt2.83□□□□□ -1.96
GEP3Q08622 HSP10YOR020C 321 nt2.83□□□□□ -1.96
GEP3Q08622 OSH6YKR003W 1347 nt2.83□□□□□ -1.96
GEP3Q08622 CWH41YGL027C 2502 nt2.83□□□□□ -1.96
GEP3Q08622 DIA2YOR080W 2199 nt2.83□□□□□ -1.96
GEP3Q08622 BNI4YNL233W 2679 nt2.82□□□□□ -1.96
GEP3Q08622 RMT2YDR465C 1239 nt2.82□□□□□ -1.96
GEP3Q08622 YIL012WYIL012W 342 nt2.82□□□□□ -1.96
GEP3Q08622 YMR046W-AYMR046W-A 129 nt2.82□□□□□ -1.96
GEP3Q08622 URA10YMR271C 684 nt2.82□□□□□ -1.96
GEP3Q08622 YNL179CYNL179C 438 nt2.82□□□□□ -1.96
GEP3Q08622 YOL085W-AYOL085W-A 213 nt2.82□□□□□ -1.96
GEP3Q08622 YBR137WYBR137W 540 nt2.82□□□□□ -1.96
GEP3Q08622 FAP7YDL166C 594 nt2.81□□□□□ -1.96
GEP3Q08622 YGR069WYGR069W 336 nt2.81□□□□□ -1.96
GEP3Q08622 YKL033W-AYKL033W-A 711 nt2.81□□□□□ -1.96
GEP3Q08622 FCF2YLR051C 654 nt2.81□□□□□ -1.96
GEP3Q08622 YPL152W-AYPL152W-A 99 nt2.81□□□□□ -1.96
GEP3Q08622 SSM4YIL030C 3960 nt2.81□□□□□ -1.96
GEP3Q08622 TCP1YDR212W 1680 nt2.81□□□□□ -1.96
GEP3Q08622 YKL222CYKL222C 2118 nt2.8□□□□□ -1.96
GEP3Q08622 PBS2YJL128C 2007 nt2.8□□□□□ -1.96
GEP3Q08622 YCR081C-AYCR081C-A 237 nt2.8□□□□□ -1.96
GEP3Q08622 CYC7YEL039C 342 nt2.8□□□□□ -1.96
GEP3Q08622 YER076W-AYER076W-A 348 nt2.8□□□□□ -1.96
GEP3Q08622 YER091C-AYER091C-A 222 nt2.8□□□□□ -1.96
GEP3Q08622 RPB9YGL070C 369 nt2.8□□□□□ -1.96
GEP3Q08622 USE1YGL098W 738 nt2.8□□□□□ -1.96
GEP3Q08622 MSL1YIR009W 336 nt2.8□□□□□ -1.96
GEP3Q08622 PET191YJR034W 327 nt2.8□□□□□ -1.96
GEP3Q08622 COX19YLL018C-A 297 nt2.8□□□□□ -1.96
GEP3Q08622 YOL160WYOL160W 342 nt2.8□□□□□ -1.96
GEP3Q08622 DGK1YOR311C 873 nt2.8□□□□□ -1.96
GEP3Q08622 YDR061WYDR061W 1620 nt2.79□□□□□ -1.96
GEP3Q08622 tC(GCA)BtC(GCA)B 72 nt2.79□□□□□ -1.96
GEP3Q08622 tC(GCA)GtC(GCA)G 72 nt2.79□□□□□ -1.96
GEP3Q08622 tC(GCA)P1tC(GCA)P1 72 nt2.79□□□□□ -1.96
GEP3Q08622 tC(GCA)P2tC(GCA)P2 72 nt2.79□□□□□ -1.96
GEP3Q08622 ATP17YDR377W 306 nt2.79□□□□□ -1.96
GEP3Q08622 TMA19YKL056C 504 nt2.79□□□□□ -1.96
GEP3Q08622 TRS120YDR407C 3870 nt2.79□□□□□ -1.96
GEP3Q08622 SRB4YER022W 2064 nt2.78□□□□□ -1.96
GEP3Q08622 SPT10YJL127C 1923 nt2.78□□□□□ -1.96
GEP3Q08622 snR80snR80 171 nt2.78□□□□□ -1.96
GEP3Q08622 YER039C-AYER039C-A 219 nt2.78□□□□□ -1.96
GEP3Q08622 ERG28YER044C 447 nt2.78□□□□□ -1.96
GEP3Q08622 LSM2YBL026W 288 nt2.78□□□□□ -1.96
GEP3Q08622 RPS7BYNL096C 573 nt2.78□□□□□ -1.96
GEP3Q08622 YPL080CYPL080C 327 nt2.78□□□□□ -1.96
GEP3Q08622 YPR099CYPR099C 357 nt2.78□□□□□ -1.96
GEP3Q08622 YPR108W-AYPR108W-A 213 nt2.78□□□□□ -1.96
GEP3Q08622 SWD3YBR175W 948 nt2.78□□□□□ -1.96
GEP3Q08622 RRN6YBL014C 2685 nt2.78□□□□□ -1.96
GEP3Q08622 NOT5YPR072W 1683 nt2.78□□□□□ -1.96
GEP3Q08622 MET5YJR137C 4329 nt2.78□□□□□ -1.96
GEP3Q08622 GCN1YGL195W 8019 nt2.78□□□□□ -1.97
GEP3Q08622 YSW1YBR148W 1830 nt2.77□□□□□ -1.97
GEP3Q08622 KHA1YJL094C 2622 nt2.77□□□□□ -1.97
GEP3Q08622 YKL100CYKL100C 1764 nt2.77□□□□□ -1.97
GEP3Q08622 SSP1YHR184W 1716 nt2.77□□□□□ -1.97
GEP3Q08622 TAF2YCR042C 4224 nt2.77□□□□□ -1.97
GEP3Q08622 YER023C-AYER023C-A 213 nt2.77□□□□□ -1.97
GEP3Q08622 CAJ1YER048C 1176 nt2.77□□□□□ -1.97
GEP3Q08622 HMF1YER057C 390 nt2.77□□□□□ -1.97
GEP3Q08622 YGL188C-AYGL188C-A 141 nt2.77□□□□□ -1.97
GEP3Q08622 NOP19YGR251W 591 nt2.77□□□□□ -1.97
GEP3Q08622 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt2.77□□□□□ -1.97
GEP3Q08622 YMR307C-AYMR307C-A 195 nt2.77□□□□□ -1.97
GEP3Q08622 PGA1YNL158W 597 nt2.77□□□□□ -1.97
GEP3Q08622 snR51snR51 107 nt2.77□□□□□ -1.97
GEP3Q08622 YDL180WYDL180W 1644 nt2.77□□□□□ -1.97
GEP3Q08622 MET6YER091C 2304 nt2.77□□□□□ -1.97
GEP3Q08622 CBP2YHL038C 1893 nt2.77□□□□□ -1.97
GEP3Q08622 RCY1YJL204C 2523 nt2.77□□□□□ -1.97
GEP3Q08622 KIN82YCR091W 2163 nt2.77□□□□□ -1.97
GEP3Q08622 NDD1YOR372C 1665 nt2.76□□□□□ -1.97
GEP3Q08622 BMS1YPL217C 3552 nt2.76□□□□□ -1.97
GEP3Q08622 RPS26BYER131W 360 nt2.76□□□□□ -1.97
GEP3Q08622 YPL142CYPL142C 318 nt2.76□□□□□ -1.97
GEP3Q08622 SLM6YBR266C 453 nt2.76□□□□□ -1.97
GEP3Q08622 SPC72YAL047C 1869 nt2.75□□□□□ -1.97
GEP3Q08622 RSN1YMR266W 2862 nt2.75□□□□□ -1.97
GEP3Q08622 NET1YJL076W 3570 nt2.75□□□□□ -1.97
GEP3Q08622 FLO1YAR050W 4614 nt2.75□□□□□ -1.97
GEP3Q08622 YDR183C-AYDR183C-A 258 nt2.75□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 46.2 ms