Protein–RNA interactions for Protein: P81133

SIM1, Single-minded homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIM1P81133 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SIM1P81133 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SIM1P81133 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SIM1P81133 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SIM1P81133 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SIM1P81133 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SIM1P81133 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIM1P81133 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIM1P81133 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIM1P81133 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIM1P81133 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIM1P81133 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIM1P81133 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIM1P81133 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIM1P81133 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIM1P81133 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIM1P81133 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIM1P81133 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIM1P81133 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIM1P81133 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIM1P81133 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIM1P81133 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIM1P81133 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIM1P81133 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIM1P81133 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIM1P81133 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SIM1P81133 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIM1P81133 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SIM1P81133 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIM1P81133 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SIM1P81133 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIM1P81133 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIM1P81133 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SIM1P81133 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIM1P81133 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIM1P81133 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIM1P81133 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIM1P81133 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIM1P81133 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIM1P81133 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIM1P81133 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIM1P81133 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SIM1P81133 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIM1P81133 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIM1P81133 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIM1P81133 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIM1P81133 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIM1P81133 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIM1P81133 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIM1P81133 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIM1P81133 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIM1P81133 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIM1P81133 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIM1P81133 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIM1P81133 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIM1P81133 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIM1P81133 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIM1P81133 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIM1P81133 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIM1P81133 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIM1P81133 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIM1P81133 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIM1P81133 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIM1P81133 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIM1P81133 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIM1P81133 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIM1P81133 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIM1P81133 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIM1P81133 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIM1P81133 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIM1P81133 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIM1P81133 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIM1P81133 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIM1P81133 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIM1P81133 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIM1P81133 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIM1P81133 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIM1P81133 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIM1P81133 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIM1P81133 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIM1P81133 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIM1P81133 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIM1P81133 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIM1P81133 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIM1P81133 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIM1P81133 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIM1P81133 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIM1P81133 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIM1P81133 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIM1P81133 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIM1P81133 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIM1P81133 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIM1P81133 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIM1P81133 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIM1P81133 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIM1P81133 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIM1P81133 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIM1P81133 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIM1P81133 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIM1P81133 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms