Protein–RNA interactions for Protein: P62318

SNRPD3, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPD3P62318 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms