Protein–RNA interactions for Protein: P62306

SNRPF, Small nuclear ribonucleoprotein F, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPFP62306 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNRPFP62306 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNRPFP62306 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNRPFP62306 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNRPFP62306 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNRPFP62306 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNRPFP62306 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNRPFP62306 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNRPFP62306 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNRPFP62306 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNRPFP62306 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNRPFP62306 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNRPFP62306 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNRPFP62306 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNRPFP62306 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNRPFP62306 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNRPFP62306 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNRPFP62306 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNRPFP62306 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNRPFP62306 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNRPFP62306 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNRPFP62306 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SNRPFP62306 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNRPFP62306 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNRPFP62306 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNRPFP62306 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNRPFP62306 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNRPFP62306 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SNRPFP62306 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SNRPFP62306 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SNRPFP62306 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SNRPFP62306 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SNRPFP62306 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SNRPFP62306 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SNRPFP62306 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNRPFP62306 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNRPFP62306 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNRPFP62306 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNRPFP62306 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNRPFP62306 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNRPFP62306 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNRPFP62306 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNRPFP62306 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SNRPFP62306 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNRPFP62306 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNRPFP62306 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNRPFP62306 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNRPFP62306 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SNRPFP62306 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNRPFP62306 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNRPFP62306 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNRPFP62306 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNRPFP62306 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNRPFP62306 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNRPFP62306 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNRPFP62306 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNRPFP62306 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNRPFP62306 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNRPFP62306 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNRPFP62306 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNRPFP62306 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNRPFP62306 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNRPFP62306 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNRPFP62306 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNRPFP62306 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNRPFP62306 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SNRPFP62306 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNRPFP62306 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNRPFP62306 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SNRPFP62306 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNRPFP62306 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNRPFP62306 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNRPFP62306 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNRPFP62306 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SNRPFP62306 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNRPFP62306 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNRPFP62306 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNRPFP62306 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNRPFP62306 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SNRPFP62306 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNRPFP62306 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNRPFP62306 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNRPFP62306 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNRPFP62306 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNRPFP62306 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNRPFP62306 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNRPFP62306 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNRPFP62306 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNRPFP62306 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SNRPFP62306 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SNRPFP62306 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNRPFP62306 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNRPFP62306 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNRPFP62306 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNRPFP62306 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNRPFP62306 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SNRPFP62306 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SNRPFP62306 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNRPFP62306 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNRPFP62306 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms