Protein–RNA interactions for Protein: P55058

PLTP, Phospholipid transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLTPP55058 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PLTPP55058 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PLTPP55058 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PLTPP55058 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PLTPP55058 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PLTPP55058 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PLTPP55058 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PLTPP55058 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PLTPP55058 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PLTPP55058 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PLTPP55058 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PLTPP55058 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PLTPP55058 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PLTPP55058 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PLTPP55058 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PLTPP55058 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PLTPP55058 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PLTPP55058 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PLTPP55058 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PLTPP55058 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PLTPP55058 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PLTPP55058 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PLTPP55058 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PLTPP55058 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PLTPP55058 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PLTPP55058 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PLTPP55058 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PLTPP55058 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PLTPP55058 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PLTPP55058 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PLTPP55058 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PLTPP55058 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PLTPP55058 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PLTPP55058 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PLTPP55058 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PLTPP55058 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PLTPP55058 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PLTPP55058 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PLTPP55058 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PLTPP55058 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PLTPP55058 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PLTPP55058 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PLTPP55058 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PLTPP55058 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PLTPP55058 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PLTPP55058 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PLTPP55058 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PLTPP55058 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PLTPP55058 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PLTPP55058 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PLTPP55058 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PLTPP55058 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PLTPP55058 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PLTPP55058 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PLTPP55058 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PLTPP55058 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PLTPP55058 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PLTPP55058 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PLTPP55058 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PLTPP55058 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PLTPP55058 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PLTPP55058 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PLTPP55058 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PLTPP55058 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PLTPP55058 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PLTPP55058 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PLTPP55058 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PLTPP55058 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PLTPP55058 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PLTPP55058 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PLTPP55058 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PLTPP55058 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PLTPP55058 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PLTPP55058 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PLTPP55058 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PLTPP55058 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PLTPP55058 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PLTPP55058 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PLTPP55058 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PLTPP55058 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PLTPP55058 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PLTPP55058 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PLTPP55058 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PLTPP55058 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PLTPP55058 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PLTPP55058 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PLTPP55058 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PLTPP55058 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PLTPP55058 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PLTPP55058 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PLTPP55058 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PLTPP55058 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PLTPP55058 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PLTPP55058 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PLTPP55058 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PLTPP55058 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PLTPP55058 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PLTPP55058 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PLTPP55058 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PLTPP55058 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms