Protein–RNA interactions for Protein: P54577

YARS, Tyrosine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 528 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YARSP54577 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
YARSP54577 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
YARSP54577 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
YARSP54577 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
YARSP54577 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
YARSP54577 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
YARSP54577 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
YARSP54577 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
YARSP54577 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
YARSP54577 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
YARSP54577 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
YARSP54577 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
YARSP54577 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
YARSP54577 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
YARSP54577 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
YARSP54577 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
YARSP54577 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
YARSP54577 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
YARSP54577 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
YARSP54577 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
YARSP54577 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
YARSP54577 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
YARSP54577 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
YARSP54577 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
YARSP54577 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
YARSP54577 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
YARSP54577 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
YARSP54577 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
YARSP54577 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
YARSP54577 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
YARSP54577 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
YARSP54577 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
YARSP54577 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
YARSP54577 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
YARSP54577 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
YARSP54577 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
YARSP54577 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
YARSP54577 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
YARSP54577 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
YARSP54577 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
YARSP54577 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
YARSP54577 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
YARSP54577 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
YARSP54577 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
YARSP54577 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
YARSP54577 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
YARSP54577 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
YARSP54577 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
YARSP54577 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
YARSP54577 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
YARSP54577 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
YARSP54577 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
YARSP54577 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
YARSP54577 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
YARSP54577 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
YARSP54577 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
YARSP54577 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
YARSP54577 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
YARSP54577 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
YARSP54577 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
YARSP54577 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
YARSP54577 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
YARSP54577 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
YARSP54577 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
YARSP54577 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
YARSP54577 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
YARSP54577 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
YARSP54577 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
YARSP54577 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
YARSP54577 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
YARSP54577 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
YARSP54577 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
YARSP54577 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
YARSP54577 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
YARSP54577 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
YARSP54577 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
YARSP54577 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
YARSP54577 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
YARSP54577 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
YARSP54577 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
YARSP54577 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
YARSP54577 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
YARSP54577 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
YARSP54577 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
YARSP54577 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
YARSP54577 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
YARSP54577 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
YARSP54577 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
YARSP54577 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
YARSP54577 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
YARSP54577 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
YARSP54577 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
YARSP54577 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
YARSP54577 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
YARSP54577 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
YARSP54577 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
YARSP54577 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
YARSP54577 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
YARSP54577 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
YARSP54577 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms