Protein–RNA interactions for Protein: P40424

PBX1, Pre-B-cell leukemia transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX1P40424 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PBX1P40424 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PBX1P40424 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PBX1P40424 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PBX1P40424 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PBX1P40424 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PBX1P40424 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PBX1P40424 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PBX1P40424 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PBX1P40424 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PBX1P40424 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PBX1P40424 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PBX1P40424 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PBX1P40424 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PBX1P40424 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PBX1P40424 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PBX1P40424 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PBX1P40424 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PBX1P40424 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PBX1P40424 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PBX1P40424 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PBX1P40424 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PBX1P40424 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PBX1P40424 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PBX1P40424 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PBX1P40424 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PBX1P40424 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PBX1P40424 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PBX1P40424 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PBX1P40424 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PBX1P40424 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PBX1P40424 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PBX1P40424 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PBX1P40424 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PBX1P40424 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PBX1P40424 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PBX1P40424 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PBX1P40424 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PBX1P40424 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PBX1P40424 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PBX1P40424 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PBX1P40424 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PBX1P40424 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PBX1P40424 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PBX1P40424 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PBX1P40424 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PBX1P40424 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PBX1P40424 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PBX1P40424 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PBX1P40424 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PBX1P40424 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PBX1P40424 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PBX1P40424 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PBX1P40424 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PBX1P40424 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PBX1P40424 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PBX1P40424 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PBX1P40424 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PBX1P40424 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PBX1P40424 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PBX1P40424 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PBX1P40424 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PBX1P40424 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PBX1P40424 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PBX1P40424 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PBX1P40424 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PBX1P40424 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PBX1P40424 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PBX1P40424 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PBX1P40424 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PBX1P40424 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PBX1P40424 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PBX1P40424 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PBX1P40424 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PBX1P40424 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PBX1P40424 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PBX1P40424 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PBX1P40424 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PBX1P40424 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PBX1P40424 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PBX1P40424 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PBX1P40424 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PBX1P40424 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PBX1P40424 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PBX1P40424 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PBX1P40424 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PBX1P40424 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PBX1P40424 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PBX1P40424 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PBX1P40424 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PBX1P40424 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PBX1P40424 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PBX1P40424 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PBX1P40424 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PBX1P40424 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PBX1P40424 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PBX1P40424 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PBX1P40424 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PBX1P40424 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PBX1P40424 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms