Protein–RNA interactions for Protein: P29536

LMOD1, Leiomodin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD1P29536 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
LMOD1P29536 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMOD1P29536 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMOD1P29536 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMOD1P29536 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMOD1P29536 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMOD1P29536 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMOD1P29536 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMOD1P29536 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMOD1P29536 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMOD1P29536 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMOD1P29536 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMOD1P29536 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMOD1P29536 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMOD1P29536 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMOD1P29536 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMOD1P29536 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMOD1P29536 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMOD1P29536 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMOD1P29536 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
LMOD1P29536 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMOD1P29536 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMOD1P29536 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMOD1P29536 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMOD1P29536 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMOD1P29536 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMOD1P29536 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMOD1P29536 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMOD1P29536 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMOD1P29536 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMOD1P29536 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMOD1P29536 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
LMOD1P29536 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMOD1P29536 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMOD1P29536 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMOD1P29536 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMOD1P29536 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMOD1P29536 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
LMOD1P29536 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMOD1P29536 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMOD1P29536 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
LMOD1P29536 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMOD1P29536 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMOD1P29536 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMOD1P29536 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LMOD1P29536 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LMOD1P29536 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LMOD1P29536 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LMOD1P29536 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LMOD1P29536 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
LMOD1P29536 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LMOD1P29536 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LMOD1P29536 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LMOD1P29536 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LMOD1P29536 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LMOD1P29536 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LMOD1P29536 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LMOD1P29536 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LMOD1P29536 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LMOD1P29536 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LMOD1P29536 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LMOD1P29536 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LMOD1P29536 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
LMOD1P29536 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
LMOD1P29536 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LMOD1P29536 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
LMOD1P29536 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LMOD1P29536 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LMOD1P29536 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LMOD1P29536 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LMOD1P29536 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LMOD1P29536 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LMOD1P29536 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LMOD1P29536 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LMOD1P29536 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LMOD1P29536 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LMOD1P29536 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LMOD1P29536 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LMOD1P29536 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LMOD1P29536 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LMOD1P29536 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LMOD1P29536 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
LMOD1P29536 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LMOD1P29536 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LMOD1P29536 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LMOD1P29536 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LMOD1P29536 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LMOD1P29536 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LMOD1P29536 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LMOD1P29536 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LMOD1P29536 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LMOD1P29536 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LMOD1P29536 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LMOD1P29536 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
LMOD1P29536 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LMOD1P29536 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LMOD1P29536 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LMOD1P29536 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
LMOD1P29536 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LMOD1P29536 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms