Protein–RNA interactions for Protein: P23634

ATP2B4, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B4P23634 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP2B4P23634 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP2B4P23634 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP2B4P23634 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP2B4P23634 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP2B4P23634 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP2B4P23634 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP2B4P23634 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP2B4P23634 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP2B4P23634 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP2B4P23634 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP2B4P23634 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP2B4P23634 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP2B4P23634 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP2B4P23634 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP2B4P23634 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP2B4P23634 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP2B4P23634 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP2B4P23634 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP2B4P23634 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP2B4P23634 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP2B4P23634 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP2B4P23634 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP2B4P23634 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP2B4P23634 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP2B4P23634 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP2B4P23634 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP2B4P23634 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP2B4P23634 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP2B4P23634 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP2B4P23634 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP2B4P23634 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP2B4P23634 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP2B4P23634 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP2B4P23634 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP2B4P23634 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP2B4P23634 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP2B4P23634 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP2B4P23634 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP2B4P23634 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP2B4P23634 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP2B4P23634 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP2B4P23634 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.6
ATP2B4P23634 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP2B4P23634 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP2B4P23634 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP2B4P23634 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP2B4P23634 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP2B4P23634 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP2B4P23634 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP2B4P23634 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP2B4P23634 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP2B4P23634 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP2B4P23634 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP2B4P23634 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP2B4P23634 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP2B4P23634 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP2B4P23634 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP2B4P23634 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP2B4P23634 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP2B4P23634 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP2B4P23634 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP2B4P23634 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP2B4P23634 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP2B4P23634 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP2B4P23634 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP2B4P23634 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP2B4P23634 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP2B4P23634 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP2B4P23634 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP2B4P23634 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP2B4P23634 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ATP2B4P23634 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATP2B4P23634 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATP2B4P23634 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATP2B4P23634 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ATP2B4P23634 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATP2B4P23634 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ATP2B4P23634 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATP2B4P23634 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATP2B4P23634 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATP2B4P23634 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATP2B4P23634 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
ATP2B4P23634 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATP2B4P23634 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATP2B4P23634 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ATP2B4P23634 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATP2B4P23634 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ATP2B4P23634 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATP2B4P23634 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP2B4P23634 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP2B4P23634 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP2B4P23634 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP2B4P23634 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP2B4P23634 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP2B4P23634 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP2B4P23634 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP2B4P23634 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP2B4P23634 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP2B4P23634 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms