Protein–RNA interactions for Protein: P10072

HKR1, Krueppel-related zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HKR1P10072 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HKR1P10072 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HKR1P10072 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HKR1P10072 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HKR1P10072 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HKR1P10072 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HKR1P10072 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HKR1P10072 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HKR1P10072 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HKR1P10072 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HKR1P10072 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HKR1P10072 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HKR1P10072 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HKR1P10072 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HKR1P10072 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HKR1P10072 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HKR1P10072 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HKR1P10072 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HKR1P10072 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HKR1P10072 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HKR1P10072 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HKR1P10072 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HKR1P10072 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HKR1P10072 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HKR1P10072 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HKR1P10072 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HKR1P10072 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HKR1P10072 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HKR1P10072 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HKR1P10072 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HKR1P10072 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HKR1P10072 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HKR1P10072 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HKR1P10072 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HKR1P10072 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HKR1P10072 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HKR1P10072 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HKR1P10072 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HKR1P10072 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HKR1P10072 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HKR1P10072 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HKR1P10072 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HKR1P10072 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HKR1P10072 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HKR1P10072 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HKR1P10072 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HKR1P10072 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HKR1P10072 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HKR1P10072 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HKR1P10072 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HKR1P10072 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HKR1P10072 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HKR1P10072 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HKR1P10072 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HKR1P10072 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HKR1P10072 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HKR1P10072 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HKR1P10072 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HKR1P10072 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HKR1P10072 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HKR1P10072 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HKR1P10072 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HKR1P10072 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HKR1P10072 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HKR1P10072 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HKR1P10072 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HKR1P10072 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HKR1P10072 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HKR1P10072 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HKR1P10072 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
HKR1P10072 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HKR1P10072 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HKR1P10072 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HKR1P10072 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HKR1P10072 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HKR1P10072 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HKR1P10072 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HKR1P10072 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HKR1P10072 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HKR1P10072 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HKR1P10072 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HKR1P10072 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HKR1P10072 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HKR1P10072 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HKR1P10072 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HKR1P10072 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HKR1P10072 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HKR1P10072 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HKR1P10072 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HKR1P10072 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HKR1P10072 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HKR1P10072 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HKR1P10072 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HKR1P10072 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HKR1P10072 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HKR1P10072 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HKR1P10072 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HKR1P10072 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
HKR1P10072 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HKR1P10072 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms