Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMEM225BP0DP42 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMEM225BP0DP42 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMEM225BP0DP42 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMEM225BP0DP42 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMEM225BP0DP42 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMEM225BP0DP42 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMEM225BP0DP42 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMEM225BP0DP42 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMEM225BP0DP42 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMEM225BP0DP42 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMEM225BP0DP42 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMEM225BP0DP42 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMEM225BP0DP42 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMEM225BP0DP42 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMEM225BP0DP42 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMEM225BP0DP42 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMEM225BP0DP42 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TMEM225BP0DP42 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMEM225BP0DP42 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMEM225BP0DP42 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMEM225BP0DP42 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMEM225BP0DP42 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMEM225BP0DP42 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMEM225BP0DP42 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMEM225BP0DP42 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMEM225BP0DP42 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMEM225BP0DP42 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMEM225BP0DP42 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMEM225BP0DP42 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMEM225BP0DP42 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMEM225BP0DP42 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMEM225BP0DP42 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMEM225BP0DP42 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMEM225BP0DP42 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMEM225BP0DP42 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMEM225BP0DP42 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMEM225BP0DP42 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMEM225BP0DP42 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TMEM225BP0DP42 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMEM225BP0DP42 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMEM225BP0DP42 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMEM225BP0DP42 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMEM225BP0DP42 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMEM225BP0DP42 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMEM225BP0DP42 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMEM225BP0DP42 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMEM225BP0DP42 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMEM225BP0DP42 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMEM225BP0DP42 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TMEM225BP0DP42 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMEM225BP0DP42 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEM225BP0DP42 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEM225BP0DP42 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEM225BP0DP42 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEM225BP0DP42 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEM225BP0DP42 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEM225BP0DP42 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEM225BP0DP42 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEM225BP0DP42 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEM225BP0DP42 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEM225BP0DP42 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEM225BP0DP42 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEM225BP0DP42 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEM225BP0DP42 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEM225BP0DP42 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEM225BP0DP42 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEM225BP0DP42 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEM225BP0DP42 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEM225BP0DP42 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEM225BP0DP42 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEM225BP0DP42 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEM225BP0DP42 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEM225BP0DP42 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEM225BP0DP42 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEM225BP0DP42 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEM225BP0DP42 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEM225BP0DP42 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEM225BP0DP42 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEM225BP0DP42 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEM225BP0DP42 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEM225BP0DP42 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEM225BP0DP42 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEM225BP0DP42 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEM225BP0DP42 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEM225BP0DP42 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEM225BP0DP42 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEM225BP0DP42 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEM225BP0DP42 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEM225BP0DP42 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEM225BP0DP42 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEM225BP0DP42 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM225BP0DP42 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM225BP0DP42 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM225BP0DP42 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM225BP0DP42 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM225BP0DP42 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM225BP0DP42 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM225BP0DP42 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM225BP0DP42 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms