Protein–RNA interactions for Protein: P04818

TYMS, Thymidylate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYMSP04818 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TYMSP04818 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TYMSP04818 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TYMSP04818 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TYMSP04818 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TYMSP04818 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TYMSP04818 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TYMSP04818 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TYMSP04818 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TYMSP04818 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TYMSP04818 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TYMSP04818 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TYMSP04818 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TYMSP04818 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TYMSP04818 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TYMSP04818 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TYMSP04818 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TYMSP04818 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TYMSP04818 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TYMSP04818 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TYMSP04818 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TYMSP04818 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TYMSP04818 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TYMSP04818 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TYMSP04818 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TYMSP04818 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TYMSP04818 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TYMSP04818 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TYMSP04818 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TYMSP04818 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TYMSP04818 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TYMSP04818 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TYMSP04818 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TYMSP04818 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TYMSP04818 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TYMSP04818 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TYMSP04818 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TYMSP04818 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TYMSP04818 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TYMSP04818 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TYMSP04818 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TYMSP04818 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TYMSP04818 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TYMSP04818 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TYMSP04818 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TYMSP04818 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TYMSP04818 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TYMSP04818 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TYMSP04818 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TYMSP04818 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TYMSP04818 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TYMSP04818 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TYMSP04818 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TYMSP04818 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TYMSP04818 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TYMSP04818 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TYMSP04818 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TYMSP04818 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TYMSP04818 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TYMSP04818 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TYMSP04818 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TYMSP04818 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TYMSP04818 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TYMSP04818 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TYMSP04818 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TYMSP04818 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TYMSP04818 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TYMSP04818 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TYMSP04818 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TYMSP04818 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TYMSP04818 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TYMSP04818 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TYMSP04818 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TYMSP04818 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TYMSP04818 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TYMSP04818 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TYMSP04818 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TYMSP04818 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TYMSP04818 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TYMSP04818 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TYMSP04818 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TYMSP04818 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TYMSP04818 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TYMSP04818 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TYMSP04818 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TYMSP04818 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TYMSP04818 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TYMSP04818 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TYMSP04818 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TYMSP04818 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TYMSP04818 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TYMSP04818 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TYMSP04818 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TYMSP04818 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TYMSP04818 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TYMSP04818 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TYMSP04818 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TYMSP04818 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TYMSP04818 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TYMSP04818 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms