Protein–RNA interactions for Protein: O75390

CS, Citrate synthase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSO75390 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CSO75390 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CSO75390 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CSO75390 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CSO75390 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CSO75390 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CSO75390 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CSO75390 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CSO75390 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CSO75390 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CSO75390 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CSO75390 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CSO75390 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CSO75390 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CSO75390 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CSO75390 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CSO75390 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CSO75390 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CSO75390 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CSO75390 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CSO75390 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CSO75390 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CSO75390 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CSO75390 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CSO75390 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CSO75390 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CSO75390 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CSO75390 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CSO75390 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CSO75390 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CSO75390 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CSO75390 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CSO75390 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CSO75390 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CSO75390 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CSO75390 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CSO75390 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CSO75390 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CSO75390 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CSO75390 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CSO75390 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CSO75390 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CSO75390 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CSO75390 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CSO75390 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CSO75390 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CSO75390 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CSO75390 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CSO75390 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CSO75390 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CSO75390 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CSO75390 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CSO75390 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CSO75390 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CSO75390 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CSO75390 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CSO75390 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CSO75390 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CSO75390 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CSO75390 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CSO75390 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CSO75390 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CSO75390 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CSO75390 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CSO75390 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CSO75390 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CSO75390 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CSO75390 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CSO75390 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CSO75390 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CSO75390 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CSO75390 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CSO75390 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
CSO75390 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CSO75390 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CSO75390 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CSO75390 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CSO75390 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CSO75390 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CSO75390 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CSO75390 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CSO75390 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CSO75390 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CSO75390 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CSO75390 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CSO75390 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CSO75390 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CSO75390 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CSO75390 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CSO75390 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CSO75390 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CSO75390 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CSO75390 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CSO75390 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CSO75390 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CSO75390 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CSO75390 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CSO75390 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CSO75390 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CSO75390 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms