Protein–RNA interactions for Protein: O75154

RAB11FIP3, Rab11 family-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP3O75154 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAB11FIP3O75154 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAB11FIP3O75154 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAB11FIP3O75154 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAB11FIP3O75154 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAB11FIP3O75154 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAB11FIP3O75154 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
RAB11FIP3O75154 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
RAB11FIP3O75154 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAB11FIP3O75154 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAB11FIP3O75154 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAB11FIP3O75154 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAB11FIP3O75154 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAB11FIP3O75154 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAB11FIP3O75154 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
RAB11FIP3O75154 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAB11FIP3O75154 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAB11FIP3O75154 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAB11FIP3O75154 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAB11FIP3O75154 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAB11FIP3O75154 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAB11FIP3O75154 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAB11FIP3O75154 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAB11FIP3O75154 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAB11FIP3O75154 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAB11FIP3O75154 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
RAB11FIP3O75154 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAB11FIP3O75154 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAB11FIP3O75154 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAB11FIP3O75154 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RAB11FIP3O75154 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAB11FIP3O75154 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RAB11FIP3O75154 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAB11FIP3O75154 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAB11FIP3O75154 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAB11FIP3O75154 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAB11FIP3O75154 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAB11FIP3O75154 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAB11FIP3O75154 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAB11FIP3O75154 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAB11FIP3O75154 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAB11FIP3O75154 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAB11FIP3O75154 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAB11FIP3O75154 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAB11FIP3O75154 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAB11FIP3O75154 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RAB11FIP3O75154 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAB11FIP3O75154 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAB11FIP3O75154 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RAB11FIP3O75154 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAB11FIP3O75154 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAB11FIP3O75154 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAB11FIP3O75154 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAB11FIP3O75154 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAB11FIP3O75154 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAB11FIP3O75154 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAB11FIP3O75154 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAB11FIP3O75154 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAB11FIP3O75154 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAB11FIP3O75154 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAB11FIP3O75154 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAB11FIP3O75154 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAB11FIP3O75154 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAB11FIP3O75154 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
RAB11FIP3O75154 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAB11FIP3O75154 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAB11FIP3O75154 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAB11FIP3O75154 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAB11FIP3O75154 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAB11FIP3O75154 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAB11FIP3O75154 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAB11FIP3O75154 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAB11FIP3O75154 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAB11FIP3O75154 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAB11FIP3O75154 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAB11FIP3O75154 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAB11FIP3O75154 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAB11FIP3O75154 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RAB11FIP3O75154 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAB11FIP3O75154 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RAB11FIP3O75154 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAB11FIP3O75154 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAB11FIP3O75154 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAB11FIP3O75154 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAB11FIP3O75154 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAB11FIP3O75154 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAB11FIP3O75154 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAB11FIP3O75154 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAB11FIP3O75154 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAB11FIP3O75154 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAB11FIP3O75154 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAB11FIP3O75154 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAB11FIP3O75154 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAB11FIP3O75154 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAB11FIP3O75154 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAB11FIP3O75154 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAB11FIP3O75154 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAB11FIP3O75154 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAB11FIP3O75154 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RAB11FIP3O75154 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms