Protein–RNA interactions for Protein: O43395

PRPF3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF3O43395 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRPF3O43395 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRPF3O43395 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PRPF3O43395 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRPF3O43395 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRPF3O43395 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRPF3O43395 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRPF3O43395 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PRPF3O43395 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRPF3O43395 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PRPF3O43395 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRPF3O43395 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRPF3O43395 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRPF3O43395 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRPF3O43395 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRPF3O43395 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRPF3O43395 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRPF3O43395 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRPF3O43395 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRPF3O43395 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRPF3O43395 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRPF3O43395 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRPF3O43395 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRPF3O43395 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRPF3O43395 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRPF3O43395 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRPF3O43395 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRPF3O43395 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRPF3O43395 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PRPF3O43395 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PRPF3O43395 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRPF3O43395 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRPF3O43395 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRPF3O43395 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRPF3O43395 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRPF3O43395 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRPF3O43395 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRPF3O43395 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRPF3O43395 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRPF3O43395 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRPF3O43395 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PRPF3O43395 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRPF3O43395 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRPF3O43395 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRPF3O43395 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRPF3O43395 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRPF3O43395 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRPF3O43395 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRPF3O43395 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRPF3O43395 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRPF3O43395 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRPF3O43395 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRPF3O43395 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRPF3O43395 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PRPF3O43395 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PRPF3O43395 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PRPF3O43395 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PRPF3O43395 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PRPF3O43395 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PRPF3O43395 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PRPF3O43395 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRPF3O43395 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRPF3O43395 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRPF3O43395 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRPF3O43395 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRPF3O43395 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRPF3O43395 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRPF3O43395 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRPF3O43395 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PRPF3O43395 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRPF3O43395 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRPF3O43395 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRPF3O43395 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRPF3O43395 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRPF3O43395 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRPF3O43395 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRPF3O43395 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRPF3O43395 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRPF3O43395 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRPF3O43395 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PRPF3O43395 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PRPF3O43395 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PRPF3O43395 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRPF3O43395 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRPF3O43395 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRPF3O43395 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRPF3O43395 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRPF3O43395 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRPF3O43395 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRPF3O43395 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRPF3O43395 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PRPF3O43395 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRPF3O43395 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PRPF3O43395 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRPF3O43395 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PRPF3O43395 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRPF3O43395 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRPF3O43395 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRPF3O43395 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRPF3O43395 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms