Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIA0

CYTH4, Cytohesin-4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH4Q9UIA0 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CYTH4Q9UIA0 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CYTH4Q9UIA0 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CYTH4Q9UIA0 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CYTH4Q9UIA0 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CYTH4Q9UIA0 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CYTH4Q9UIA0 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CYTH4Q9UIA0 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CYTH4Q9UIA0 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CYTH4Q9UIA0 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CYTH4Q9UIA0 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CYTH4Q9UIA0 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CYTH4Q9UIA0 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CYTH4Q9UIA0 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CYTH4Q9UIA0 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CYTH4Q9UIA0 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CYTH4Q9UIA0 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CYTH4Q9UIA0 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CYTH4Q9UIA0 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CYTH4Q9UIA0 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CYTH4Q9UIA0 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CYTH4Q9UIA0 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CYTH4Q9UIA0 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CYTH4Q9UIA0 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CYTH4Q9UIA0 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CYTH4Q9UIA0 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CYTH4Q9UIA0 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CYTH4Q9UIA0 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CYTH4Q9UIA0 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CYTH4Q9UIA0 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CYTH4Q9UIA0 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CYTH4Q9UIA0 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CYTH4Q9UIA0 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CYTH4Q9UIA0 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CYTH4Q9UIA0 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CYTH4Q9UIA0 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CYTH4Q9UIA0 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CYTH4Q9UIA0 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CYTH4Q9UIA0 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CYTH4Q9UIA0 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CYTH4Q9UIA0 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CYTH4Q9UIA0 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CYTH4Q9UIA0 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CYTH4Q9UIA0 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CYTH4Q9UIA0 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CYTH4Q9UIA0 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CYTH4Q9UIA0 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CYTH4Q9UIA0 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CYTH4Q9UIA0 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CYTH4Q9UIA0 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CYTH4Q9UIA0 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CYTH4Q9UIA0 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CYTH4Q9UIA0 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CYTH4Q9UIA0 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CYTH4Q9UIA0 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CYTH4Q9UIA0 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CYTH4Q9UIA0 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CYTH4Q9UIA0 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CYTH4Q9UIA0 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CYTH4Q9UIA0 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CYTH4Q9UIA0 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CYTH4Q9UIA0 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CYTH4Q9UIA0 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CYTH4Q9UIA0 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CYTH4Q9UIA0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CYTH4Q9UIA0 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CYTH4Q9UIA0 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CYTH4Q9UIA0 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CYTH4Q9UIA0 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CYTH4Q9UIA0 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CYTH4Q9UIA0 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CYTH4Q9UIA0 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CYTH4Q9UIA0 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CYTH4Q9UIA0 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CYTH4Q9UIA0 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CYTH4Q9UIA0 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CYTH4Q9UIA0 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CYTH4Q9UIA0 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CYTH4Q9UIA0 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CYTH4Q9UIA0 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CYTH4Q9UIA0 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CYTH4Q9UIA0 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CYTH4Q9UIA0 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CYTH4Q9UIA0 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CYTH4Q9UIA0 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CYTH4Q9UIA0 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CYTH4Q9UIA0 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CYTH4Q9UIA0 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CYTH4Q9UIA0 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CYTH4Q9UIA0 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CYTH4Q9UIA0 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CYTH4Q9UIA0 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CYTH4Q9UIA0 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CYTH4Q9UIA0 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CYTH4Q9UIA0 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CYTH4Q9UIA0 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CYTH4Q9UIA0 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CYTH4Q9UIA0 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CYTH4Q9UIA0 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CYTH4Q9UIA0 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms