Protein–RNA interactions for Protein: Q9P031

CCDC59, Thyroid transcription factor 1-associated protein 26, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC59Q9P031 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC59Q9P031 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC59Q9P031 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC59Q9P031 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC59Q9P031 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC59Q9P031 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC59Q9P031 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC59Q9P031 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC59Q9P031 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC59Q9P031 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC59Q9P031 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC59Q9P031 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC59Q9P031 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC59Q9P031 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC59Q9P031 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC59Q9P031 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC59Q9P031 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC59Q9P031 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC59Q9P031 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC59Q9P031 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC59Q9P031 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC59Q9P031 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC59Q9P031 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC59Q9P031 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC59Q9P031 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC59Q9P031 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC59Q9P031 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC59Q9P031 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC59Q9P031 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC59Q9P031 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC59Q9P031 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC59Q9P031 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC59Q9P031 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC59Q9P031 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC59Q9P031 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC59Q9P031 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC59Q9P031 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC59Q9P031 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC59Q9P031 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC59Q9P031 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC59Q9P031 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC59Q9P031 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC59Q9P031 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC59Q9P031 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC59Q9P031 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC59Q9P031 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CCDC59Q9P031 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC59Q9P031 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC59Q9P031 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC59Q9P031 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC59Q9P031 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC59Q9P031 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC59Q9P031 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC59Q9P031 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC59Q9P031 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC59Q9P031 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC59Q9P031 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC59Q9P031 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC59Q9P031 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC59Q9P031 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC59Q9P031 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC59Q9P031 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC59Q9P031 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC59Q9P031 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC59Q9P031 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC59Q9P031 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC59Q9P031 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC59Q9P031 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC59Q9P031 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC59Q9P031 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC59Q9P031 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC59Q9P031 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC59Q9P031 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC59Q9P031 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC59Q9P031 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC59Q9P031 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC59Q9P031 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC59Q9P031 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC59Q9P031 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC59Q9P031 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC59Q9P031 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC59Q9P031 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC59Q9P031 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC59Q9P031 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC59Q9P031 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC59Q9P031 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC59Q9P031 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC59Q9P031 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC59Q9P031 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC59Q9P031 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC59Q9P031 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC59Q9P031 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC59Q9P031 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC59Q9P031 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC59Q9P031 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC59Q9P031 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC59Q9P031 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC59Q9P031 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC59Q9P031 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC59Q9P031 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms