Protein–RNA interactions for Protein: Q9C035

TRIM5, Tripartite motif-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM5Q9C035 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM5Q9C035 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM5Q9C035 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM5Q9C035 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM5Q9C035 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRIM5Q9C035 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRIM5Q9C035 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRIM5Q9C035 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRIM5Q9C035 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRIM5Q9C035 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRIM5Q9C035 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRIM5Q9C035 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRIM5Q9C035 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM5Q9C035 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM5Q9C035 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM5Q9C035 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM5Q9C035 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM5Q9C035 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM5Q9C035 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM5Q9C035 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM5Q9C035 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM5Q9C035 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM5Q9C035 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM5Q9C035 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM5Q9C035 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM5Q9C035 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM5Q9C035 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM5Q9C035 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM5Q9C035 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM5Q9C035 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM5Q9C035 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM5Q9C035 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM5Q9C035 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM5Q9C035 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM5Q9C035 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM5Q9C035 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM5Q9C035 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM5Q9C035 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM5Q9C035 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM5Q9C035 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM5Q9C035 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM5Q9C035 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM5Q9C035 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM5Q9C035 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM5Q9C035 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM5Q9C035 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM5Q9C035 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM5Q9C035 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM5Q9C035 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM5Q9C035 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM5Q9C035 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM5Q9C035 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM5Q9C035 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM5Q9C035 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM5Q9C035 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM5Q9C035 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM5Q9C035 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM5Q9C035 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM5Q9C035 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM5Q9C035 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM5Q9C035 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM5Q9C035 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM5Q9C035 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM5Q9C035 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM5Q9C035 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM5Q9C035 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM5Q9C035 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM5Q9C035 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM5Q9C035 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM5Q9C035 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM5Q9C035 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM5Q9C035 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM5Q9C035 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM5Q9C035 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM5Q9C035 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM5Q9C035 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM5Q9C035 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM5Q9C035 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM5Q9C035 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM5Q9C035 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM5Q9C035 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM5Q9C035 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM5Q9C035 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM5Q9C035 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM5Q9C035 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM5Q9C035 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM5Q9C035 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM5Q9C035 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM5Q9C035 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM5Q9C035 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM5Q9C035 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM5Q9C035 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM5Q9C035 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM5Q9C035 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM5Q9C035 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM5Q9C035 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM5Q9C035 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM5Q9C035 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM5Q9C035 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM5Q9C035 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms