Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU61

NDUFAF3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAF3Q9BU61 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFAF3Q9BU61 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFAF3Q9BU61 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFAF3Q9BU61 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFAF3Q9BU61 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFAF3Q9BU61 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFAF3Q9BU61 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFAF3Q9BU61 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFAF3Q9BU61 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFAF3Q9BU61 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFAF3Q9BU61 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFAF3Q9BU61 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFAF3Q9BU61 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFAF3Q9BU61 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFAF3Q9BU61 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFAF3Q9BU61 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFAF3Q9BU61 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFAF3Q9BU61 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFAF3Q9BU61 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFAF3Q9BU61 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFAF3Q9BU61 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFAF3Q9BU61 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFAF3Q9BU61 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFAF3Q9BU61 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFAF3Q9BU61 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFAF3Q9BU61 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFAF3Q9BU61 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFAF3Q9BU61 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFAF3Q9BU61 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFAF3Q9BU61 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFAF3Q9BU61 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFAF3Q9BU61 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFAF3Q9BU61 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFAF3Q9BU61 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFAF3Q9BU61 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFAF3Q9BU61 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFAF3Q9BU61 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFAF3Q9BU61 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFAF3Q9BU61 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFAF3Q9BU61 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFAF3Q9BU61 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFAF3Q9BU61 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFAF3Q9BU61 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFAF3Q9BU61 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFAF3Q9BU61 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFAF3Q9BU61 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFAF3Q9BU61 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFAF3Q9BU61 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFAF3Q9BU61 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFAF3Q9BU61 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFAF3Q9BU61 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFAF3Q9BU61 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFAF3Q9BU61 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NDUFAF3Q9BU61 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NDUFAF3Q9BU61 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NDUFAF3Q9BU61 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NDUFAF3Q9BU61 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NDUFAF3Q9BU61 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NDUFAF3Q9BU61 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NDUFAF3Q9BU61 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFAF3Q9BU61 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFAF3Q9BU61 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFAF3Q9BU61 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFAF3Q9BU61 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFAF3Q9BU61 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFAF3Q9BU61 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFAF3Q9BU61 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFAF3Q9BU61 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFAF3Q9BU61 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFAF3Q9BU61 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFAF3Q9BU61 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFAF3Q9BU61 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFAF3Q9BU61 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFAF3Q9BU61 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFAF3Q9BU61 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFAF3Q9BU61 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFAF3Q9BU61 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFAF3Q9BU61 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDUFAF3Q9BU61 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDUFAF3Q9BU61 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NDUFAF3Q9BU61 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDUFAF3Q9BU61 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDUFAF3Q9BU61 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDUFAF3Q9BU61 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDUFAF3Q9BU61 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDUFAF3Q9BU61 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDUFAF3Q9BU61 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDUFAF3Q9BU61 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDUFAF3Q9BU61 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDUFAF3Q9BU61 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDUFAF3Q9BU61 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDUFAF3Q9BU61 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDUFAF3Q9BU61 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDUFAF3Q9BU61 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDUFAF3Q9BU61 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDUFAF3Q9BU61 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDUFAF3Q9BU61 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NDUFAF3Q9BU61 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDUFAF3Q9BU61 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDUFAF3Q9BU61 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms