Protein–RNA interactions for Protein: Q96CV9

OPTN, Optineurin, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPTNQ96CV9 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
OPTNQ96CV9 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
OPTNQ96CV9 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
OPTNQ96CV9 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
OPTNQ96CV9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
OPTNQ96CV9 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
OPTNQ96CV9 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
OPTNQ96CV9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
OPTNQ96CV9 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
OPTNQ96CV9 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
OPTNQ96CV9 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
OPTNQ96CV9 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
OPTNQ96CV9 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
OPTNQ96CV9 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
OPTNQ96CV9 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
OPTNQ96CV9 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
OPTNQ96CV9 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
OPTNQ96CV9 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
OPTNQ96CV9 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
OPTNQ96CV9 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
OPTNQ96CV9 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
OPTNQ96CV9 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
OPTNQ96CV9 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
OPTNQ96CV9 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
OPTNQ96CV9 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
OPTNQ96CV9 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
OPTNQ96CV9 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
OPTNQ96CV9 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
OPTNQ96CV9 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
OPTNQ96CV9 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
OPTNQ96CV9 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
OPTNQ96CV9 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
OPTNQ96CV9 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
OPTNQ96CV9 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
OPTNQ96CV9 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
OPTNQ96CV9 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
OPTNQ96CV9 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
OPTNQ96CV9 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
OPTNQ96CV9 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
OPTNQ96CV9 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
OPTNQ96CV9 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
OPTNQ96CV9 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
OPTNQ96CV9 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
OPTNQ96CV9 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
OPTNQ96CV9 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
OPTNQ96CV9 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
OPTNQ96CV9 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
OPTNQ96CV9 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
OPTNQ96CV9 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
OPTNQ96CV9 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
OPTNQ96CV9 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
OPTNQ96CV9 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
OPTNQ96CV9 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
OPTNQ96CV9 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
OPTNQ96CV9 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
OPTNQ96CV9 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
OPTNQ96CV9 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
OPTNQ96CV9 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
OPTNQ96CV9 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
OPTNQ96CV9 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
OPTNQ96CV9 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
OPTNQ96CV9 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
OPTNQ96CV9 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
OPTNQ96CV9 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
OPTNQ96CV9 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
OPTNQ96CV9 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
OPTNQ96CV9 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
OPTNQ96CV9 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
OPTNQ96CV9 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
OPTNQ96CV9 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
OPTNQ96CV9 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
OPTNQ96CV9 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
OPTNQ96CV9 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
OPTNQ96CV9 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
OPTNQ96CV9 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
OPTNQ96CV9 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
OPTNQ96CV9 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
OPTNQ96CV9 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
OPTNQ96CV9 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
OPTNQ96CV9 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
OPTNQ96CV9 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
OPTNQ96CV9 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
OPTNQ96CV9 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC24■■□□□ 1.43
OPTNQ96CV9 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
OPTNQ96CV9 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
OPTNQ96CV9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
OPTNQ96CV9 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
OPTNQ96CV9 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
OPTNQ96CV9 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
OPTNQ96CV9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
OPTNQ96CV9 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
OPTNQ96CV9 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
OPTNQ96CV9 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
OPTNQ96CV9 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
OPTNQ96CV9 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
OPTNQ96CV9 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
OPTNQ96CV9 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
OPTNQ96CV9 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
OPTNQ96CV9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
OPTNQ96CV9 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms