Protein–RNA interactions for Protein: Q969Z0

TBRG4, Protein TBRG4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG4Q969Z0 UPF3B-201ENST00000276201 2378 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.765e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 CBFA2T2-203ENST00000346541 7737 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.795e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 SLC25A17-213ENST00000449676 533 ntTSL 410.03□□□□□ -0.85e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 DENND1A-211ENST00000491650 842 ntTSL 510.03□□□□□ -0.85e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 RPS10-NUDT3-203ENST00000639877 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.85e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 FTO-210ENST00000612285 1852 ntTSL 59.95□□□□□ -0.825e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 OSBPL5-217ENST00000534157 706 ntTSL 49.88□□□□□ -0.835e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 MFSD14C-206ENST00000637409 836 ntTSL 39.85□□□□□ -0.835e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 ACVR1-202ENST00000409283 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.855e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 MAP3K3-207ENST00000578622 560 ntTSL 49.69□□□□□ -0.865e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 CBFA2T2-204ENST00000359606 7274 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.875e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 WDR61-209ENST00000559848 756 ntTSL 39.45□□□□□ -0.95e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 SLC25A17-201ENST00000263255 2058 ntTSL 1 (best)9.32□□□□□ -0.925e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 EVL-221ENST00000557023 507 ntTSL 29.12□□□□□ -0.955e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 DENND1A-204ENST00000394215 1380 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.955e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 CBFA2T2-209ENST00000492345 7803 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.975e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 SFR1-202ENST00000369729 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.995e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 SLC25A17-216ENST00000491545 2530 ntTSL 1 (best)8.84□□□□□ -0.995e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 WDR61-202ENST00000558311 1266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.81□□□□□ -15e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 SLC25A17-204ENST00000420970 1060 ntTSL 58.72□□□□□ -1.015e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 SLC25A17-205ENST00000426396 641 ntTSL 58.72□□□□□ -1.015e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 SATB1-AS1-221ENST00000599762 655 ntTSL 58.69□□□□□ -1.025e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 ARHGDIB-203ENST00000536592 1063 ntTSL 38.62□□□□□ -1.035e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 WDR61-208ENST00000559700 948 ntTSL 28.59□□□□□ -1.035e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 HHIP-201ENST00000296575 10072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.045e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 SATB1-AS1-212ENST00000596152 610 ntTSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.075e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 PRLR-215ENST00000515839 581 ntTSL 28.33□□□□□ -1.085e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 ARHGDIB-201ENST00000228945 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.095e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 AL121761.1-201ENST00000432334 287 ntTSL 48.14□□□□□ -1.115e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 NPAT-205ENST00000531384 575 ntTSL 58.13□□□□□ -1.115e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 2191 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.125e-13■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 MAP3K3-211ENST00000585302 678 ntTSL 38.03□□□□□ -1.125e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 SLC25A17-209ENST00000434193 598 ntTSL 47.98□□□□□ -1.135e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 MSRB1-203ENST00000473663 373 ntTSL 57.61□□□□□ -1.195e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 SLC25A17-207ENST00000430221 734 ntTSL 47.54□□□□□ -1.25e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 SATB1-AS1-229ENST00000626023 932 ntTSL 57.47□□□□□ -1.215e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 BAZ2A-212ENST00000550730 515 ntTSL 47.38□□□□□ -1.235e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 BAZ2A-208ENST00000549506 577 ntTSL 27.38□□□□□ -1.235e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 SATB1-AS1-272ENST00000631123 854 ntTSL 57.32□□□□□ -1.245e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 SFR1-201ENST00000369727 1438 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.255e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 MED12L-206ENST00000474524 10744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.287e-19■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 PRLR-207ENST00000508107 1934 ntTSL 37.06□□□□□ -1.285e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 ASAP1-212ENST00000521426 566 ntTSL 46.94□□□□□ -1.35e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 MFSD14C-202ENST00000506067 548 ntTSL 56.9□□□□□ -1.35e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 RPS10-NUDT3-201ENST00000605528 595 ntTSL 56.75□□□□□ -1.335e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 UPF3B-205ENST00000636792 834 ntTSL 56.71□□□□□ -1.345e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 WDR61-213ENST00000560610 832 ntTSL 56.59□□□□□ -1.355e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 SATB1-AS1-268ENST00000630749 882 ntTSL 56.52□□□□□ -1.375e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 SLC25A17-212ENST00000447566 1243 ntTSL 56.51□□□□□ -1.375e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 EVL-224ENST00000557637 501 ntTSL 26.11□□□□□ -1.435e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 SATB1-AS1-244ENST00000627668 667 ntTSL 56.1□□□□□ -1.435e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 FTO-202ENST00000431610 707 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.485e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 FTO-204ENST00000463855 3056 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.55e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 VARS-222ENST00000470953 392 ntTSL 35.63□□□□□ -1.515e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 WDR61-205ENST00000558459 884 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.525e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 SATB1-AS1-240ENST00000627379 538 ntTSL 55.36□□□□□ -1.555e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 SATB1-AS1-211ENST00000596139 582 ntTSL 55.09□□□□□ -1.595e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 MED12L-209ENST00000491549 575 ntTSL 45.04□□□□□ -1.65e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 SATB1-AS1-233ENST00000626737 898 ntTSL 55.04□□□□□ -1.65e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 SATB1-AS1-260ENST00000629516 847 ntTSL 55□□□□□ -1.615e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 MED12L-201ENST00000273432 6401 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.627e-19■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 NPAT-206ENST00000610253 3959 ntTSL 24.9□□□□□ -1.625e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 SATB1-AS1-208ENST00000595250 604 ntTSL 54.86□□□□□ -1.635e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 SATB1-AS1-263ENST00000630022 622 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.635e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 FTO-211ENST00000635892 1085 ntTSL 54.82□□□□□ -1.645e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 PRLR-217ENST00000618457 11688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.645e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 FTO-201ENST00000268349 2799 ntTSL 1 (best)4.79□□□□□ -1.645e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 SATB1-AS1-250ENST00000628425 592 ntTSL 54.75□□□□□ -1.655e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 SATB1-AS1-264ENST00000630073 812 ntTSL 54.18□□□□□ -1.745e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 SATB1-AS1-210ENST00000595865 868 ntTSL 54.14□□□□□ -1.755e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 FTO-203ENST00000460382 1517 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.755e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 PRH1-203ENST00000538332 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 54.1□□□□□ -1.755e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 SATB1-AS1-222ENST00000600177 751 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.765e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 SATB1-AS1-205ENST00000456253 808 ntTSL 54.06□□□□□ -1.765e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 NBEAL1-208ENST00000483147 449 ntTSL 53.98□□□□□ -1.775e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 SATB1-AS1-214ENST00000596307 878 ntTSL 53.92□□□□□ -1.785e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 SATB1-AS1-259ENST00000629477 853 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.785e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 SATB1-AS1-228ENST00000625591 1008 ntTSL 53.58□□□□□ -1.845e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 NBEAL1-203ENST00000449802 10938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.865e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 SATB1-AS1-237ENST00000626982 735 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.95e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 SATB1-AS1-258ENST00000629405 664 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.915e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 SATB1-AS1-232ENST00000626606 685 ntTSL 53.09□□□□□ -1.915e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 SATB1-AS1-254ENST00000628891 798 ntTSL 53.09□□□□□ -1.915e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 SATB1-AS1-248ENST00000628209 682 ntTSL 53.09□□□□□ -1.915e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 SATB1-AS1-266ENST00000630271 813 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.955e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 SATB1-AS1-209ENST00000595388 788 ntTSL 52.72□□□□□ -1.975e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 PRLR-206ENST00000504500 583 ntTSL 32.7□□□□□ -1.985e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 SFR1-203ENST00000463224 496 ntTSL 32.62□□□□□ -1.995e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 SATB1-AS1-253ENST00000628778 761 ntTSL 51.91□□□□□ -2.15e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 SATB1-AS1-217ENST00000598390 714 ntTSL 51.91□□□□□ -2.15e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 SATB1-AS1-239ENST00000627192 714 ntTSL 51.91□□□□□ -2.15e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 MED12L-207ENST00000480026 749 ntTSL 51.88□□□□□ -2.115e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.195e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.16□□□□□ -2.225e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 SATB1-AS1-267ENST00000630609 320 ntTSL 50.92□□□□□ -2.265e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.042e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 FMR1-216ENST00000616614 1409 ntTSL 531.3■■■□□ 2.62e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.442e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 RAB40C-211ENST00000568586 648 ntTSL 228.63■■■□□ 2.172e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 MXD3-206ENST00000503782 1854 ntTSL 227.75■■■□□ 2.032e-6■■■■■ 54.9
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