Protein–RNA interactions for Protein: Q969G9

NKD1, Protein naked cuticle homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD1Q969G9 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NKD1Q969G9 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NKD1Q969G9 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
NKD1Q969G9 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NKD1Q969G9 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NKD1Q969G9 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NKD1Q969G9 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NKD1Q969G9 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
NKD1Q969G9 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NKD1Q969G9 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NKD1Q969G9 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NKD1Q969G9 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NKD1Q969G9 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NKD1Q969G9 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NKD1Q969G9 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NKD1Q969G9 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NKD1Q969G9 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NKD1Q969G9 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NKD1Q969G9 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NKD1Q969G9 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NKD1Q969G9 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NKD1Q969G9 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NKD1Q969G9 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NKD1Q969G9 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NKD1Q969G9 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NKD1Q969G9 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NKD1Q969G9 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NKD1Q969G9 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
NKD1Q969G9 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NKD1Q969G9 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
NKD1Q969G9 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NKD1Q969G9 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NKD1Q969G9 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NKD1Q969G9 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
NKD1Q969G9 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NKD1Q969G9 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NKD1Q969G9 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NKD1Q969G9 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NKD1Q969G9 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NKD1Q969G9 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NKD1Q969G9 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NKD1Q969G9 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NKD1Q969G9 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NKD1Q969G9 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NKD1Q969G9 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
NKD1Q969G9 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NKD1Q969G9 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NKD1Q969G9 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NKD1Q969G9 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NKD1Q969G9 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NKD1Q969G9 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NKD1Q969G9 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NKD1Q969G9 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NKD1Q969G9 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NKD1Q969G9 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NKD1Q969G9 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NKD1Q969G9 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NKD1Q969G9 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NKD1Q969G9 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NKD1Q969G9 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NKD1Q969G9 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NKD1Q969G9 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NKD1Q969G9 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NKD1Q969G9 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NKD1Q969G9 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NKD1Q969G9 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NKD1Q969G9 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NKD1Q969G9 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NKD1Q969G9 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NKD1Q969G9 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NKD1Q969G9 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NKD1Q969G9 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NKD1Q969G9 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NKD1Q969G9 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NKD1Q969G9 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NKD1Q969G9 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NKD1Q969G9 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NKD1Q969G9 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NKD1Q969G9 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NKD1Q969G9 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NKD1Q969G9 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NKD1Q969G9 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NKD1Q969G9 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NKD1Q969G9 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NKD1Q969G9 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NKD1Q969G9 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NKD1Q969G9 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NKD1Q969G9 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
NKD1Q969G9 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NKD1Q969G9 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NKD1Q969G9 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NKD1Q969G9 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NKD1Q969G9 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NKD1Q969G9 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NKD1Q969G9 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
NKD1Q969G9 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NKD1Q969G9 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NKD1Q969G9 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NKD1Q969G9 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NKD1Q969G9 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms