Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PHF3Q92576 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PHF3Q92576 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PHF3Q92576 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PHF3Q92576 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PHF3Q92576 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PHF3Q92576 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PHF3Q92576 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PHF3Q92576 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PHF3Q92576 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PHF3Q92576 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PHF3Q92576 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PHF3Q92576 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PHF3Q92576 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PHF3Q92576 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PHF3Q92576 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PHF3Q92576 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PHF3Q92576 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PHF3Q92576 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PHF3Q92576 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PHF3Q92576 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PHF3Q92576 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PHF3Q92576 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PHF3Q92576 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PHF3Q92576 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PHF3Q92576 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PHF3Q92576 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PHF3Q92576 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PHF3Q92576 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PHF3Q92576 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PHF3Q92576 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PHF3Q92576 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PHF3Q92576 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PHF3Q92576 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PHF3Q92576 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PHF3Q92576 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PHF3Q92576 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PHF3Q92576 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PHF3Q92576 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PHF3Q92576 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PHF3Q92576 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PHF3Q92576 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PHF3Q92576 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PHF3Q92576 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PHF3Q92576 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PHF3Q92576 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PHF3Q92576 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PHF3Q92576 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PHF3Q92576 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PHF3Q92576 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PHF3Q92576 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PHF3Q92576 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PHF3Q92576 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PHF3Q92576 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PHF3Q92576 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PHF3Q92576 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PHF3Q92576 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PHF3Q92576 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PHF3Q92576 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PHF3Q92576 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PHF3Q92576 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PHF3Q92576 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PHF3Q92576 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PHF3Q92576 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PHF3Q92576 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PHF3Q92576 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PHF3Q92576 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PHF3Q92576 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PHF3Q92576 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PHF3Q92576 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PHF3Q92576 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PHF3Q92576 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PHF3Q92576 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PHF3Q92576 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PHF3Q92576 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PHF3Q92576 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PHF3Q92576 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PHF3Q92576 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PHF3Q92576 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PHF3Q92576 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PHF3Q92576 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PHF3Q92576 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PHF3Q92576 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PHF3Q92576 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PHF3Q92576 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PHF3Q92576 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PHF3Q92576 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PHF3Q92576 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PHF3Q92576 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PHF3Q92576 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PHF3Q92576 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PHF3Q92576 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PHF3Q92576 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PHF3Q92576 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PHF3Q92576 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PHF3Q92576 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PHF3Q92576 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PHF3Q92576 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PHF3Q92576 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PHF3Q92576 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms