Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
TRIM41Q8WV44 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
TRIM41Q8WV44 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
TRIM41Q8WV44 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
TRIM41Q8WV44 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
TRIM41Q8WV44 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
TRIM41Q8WV44 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
TRIM41Q8WV44 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC35.34■■■■□ 3.25
TRIM41Q8WV44 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
TRIM41Q8WV44 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
TRIM41Q8WV44 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
TRIM41Q8WV44 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
TRIM41Q8WV44 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
TRIM41Q8WV44 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
TRIM41Q8WV44 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
TRIM41Q8WV44 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC35.33■■■■□ 3.25
TRIM41Q8WV44 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC35.33■■■■□ 3.25
TRIM41Q8WV44 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC35.33■■■■□ 3.25
TRIM41Q8WV44 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
TRIM41Q8WV44 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
TRIM41Q8WV44 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
TRIM41Q8WV44 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
TRIM41Q8WV44 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
TRIM41Q8WV44 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.25
TRIM41Q8WV44 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
TRIM41Q8WV44 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
TRIM41Q8WV44 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
TRIM41Q8WV44 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
TRIM41Q8WV44 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC35.32■■■■□ 3.24
TRIM41Q8WV44 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
TRIM41Q8WV44 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
TRIM41Q8WV44 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
TRIM41Q8WV44 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
TRIM41Q8WV44 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
TRIM41Q8WV44 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
TRIM41Q8WV44 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
TRIM41Q8WV44 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
TRIM41Q8WV44 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC35.31■■■■□ 3.24
TRIM41Q8WV44 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
TRIM41Q8WV44 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
TRIM41Q8WV44 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
TRIM41Q8WV44 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
TRIM41Q8WV44 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
TRIM41Q8WV44 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
TRIM41Q8WV44 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC35.3■■■■□ 3.24
TRIM41Q8WV44 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
TRIM41Q8WV44 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
TRIM41Q8WV44 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
TRIM41Q8WV44 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
TRIM41Q8WV44 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
TRIM41Q8WV44 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
TRIM41Q8WV44 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.29■■■■□ 3.24
TRIM41Q8WV44 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
TRIM41Q8WV44 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC35.29■■■■□ 3.24
TRIM41Q8WV44 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
TRIM41Q8WV44 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
TRIM41Q8WV44 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
TRIM41Q8WV44 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
TRIM41Q8WV44 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
TRIM41Q8WV44 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
TRIM41Q8WV44 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
TRIM41Q8WV44 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
TRIM41Q8WV44 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
TRIM41Q8WV44 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
TRIM41Q8WV44 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
TRIM41Q8WV44 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
TRIM41Q8WV44 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
TRIM41Q8WV44 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
TRIM41Q8WV44 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
TRIM41Q8WV44 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
TRIM41Q8WV44 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
TRIM41Q8WV44 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
TRIM41Q8WV44 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
TRIM41Q8WV44 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC35.27■■■■□ 3.24
TRIM41Q8WV44 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
TRIM41Q8WV44 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
TRIM41Q8WV44 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
TRIM41Q8WV44 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
TRIM41Q8WV44 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
TRIM41Q8WV44 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.24
TRIM41Q8WV44 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
TRIM41Q8WV44 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC35.26■■■■□ 3.24
TRIM41Q8WV44 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC35.26■■■■□ 3.24
TRIM41Q8WV44 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.24
TRIM41Q8WV44 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC35.26■■■■□ 3.24
TRIM41Q8WV44 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.23
TRIM41Q8WV44 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
TRIM41Q8WV44 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC35.26■■■■□ 3.23
TRIM41Q8WV44 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.23
TRIM41Q8WV44 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
TRIM41Q8WV44 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
TRIM41Q8WV44 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
TRIM41Q8WV44 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
TRIM41Q8WV44 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
TRIM41Q8WV44 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
TRIM41Q8WV44 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
TRIM41Q8WV44 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
TRIM41Q8WV44 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
TRIM41Q8WV44 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
TRIM41Q8WV44 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms