Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU1

BEST2, Bestrophin-2, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST2Q8NFU1 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BEST2Q8NFU1 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BEST2Q8NFU1 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BEST2Q8NFU1 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BEST2Q8NFU1 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BEST2Q8NFU1 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BEST2Q8NFU1 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
BEST2Q8NFU1 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BEST2Q8NFU1 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BEST2Q8NFU1 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BEST2Q8NFU1 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BEST2Q8NFU1 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BEST2Q8NFU1 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BEST2Q8NFU1 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BEST2Q8NFU1 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BEST2Q8NFU1 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
BEST2Q8NFU1 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BEST2Q8NFU1 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BEST2Q8NFU1 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BEST2Q8NFU1 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BEST2Q8NFU1 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BEST2Q8NFU1 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
BEST2Q8NFU1 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BEST2Q8NFU1 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BEST2Q8NFU1 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BEST2Q8NFU1 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BEST2Q8NFU1 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BEST2Q8NFU1 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BEST2Q8NFU1 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
BEST2Q8NFU1 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BEST2Q8NFU1 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BEST2Q8NFU1 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BEST2Q8NFU1 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BEST2Q8NFU1 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BEST2Q8NFU1 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BEST2Q8NFU1 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BEST2Q8NFU1 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BEST2Q8NFU1 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BEST2Q8NFU1 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BEST2Q8NFU1 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BEST2Q8NFU1 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BEST2Q8NFU1 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BEST2Q8NFU1 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BEST2Q8NFU1 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BEST2Q8NFU1 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BEST2Q8NFU1 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BEST2Q8NFU1 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BEST2Q8NFU1 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BEST2Q8NFU1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BEST2Q8NFU1 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BEST2Q8NFU1 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
BEST2Q8NFU1 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BEST2Q8NFU1 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BEST2Q8NFU1 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BEST2Q8NFU1 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BEST2Q8NFU1 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BEST2Q8NFU1 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BEST2Q8NFU1 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BEST2Q8NFU1 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BEST2Q8NFU1 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BEST2Q8NFU1 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BEST2Q8NFU1 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BEST2Q8NFU1 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BEST2Q8NFU1 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BEST2Q8NFU1 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BEST2Q8NFU1 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BEST2Q8NFU1 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BEST2Q8NFU1 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BEST2Q8NFU1 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
BEST2Q8NFU1 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BEST2Q8NFU1 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
BEST2Q8NFU1 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
BEST2Q8NFU1 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BEST2Q8NFU1 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BEST2Q8NFU1 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BEST2Q8NFU1 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BEST2Q8NFU1 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BEST2Q8NFU1 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BEST2Q8NFU1 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BEST2Q8NFU1 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BEST2Q8NFU1 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BEST2Q8NFU1 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BEST2Q8NFU1 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BEST2Q8NFU1 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BEST2Q8NFU1 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BEST2Q8NFU1 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BEST2Q8NFU1 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
BEST2Q8NFU1 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BEST2Q8NFU1 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BEST2Q8NFU1 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BEST2Q8NFU1 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BEST2Q8NFU1 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
BEST2Q8NFU1 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BEST2Q8NFU1 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
BEST2Q8NFU1 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BEST2Q8NFU1 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BEST2Q8NFU1 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BEST2Q8NFU1 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BEST2Q8NFU1 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BEST2Q8NFU1 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms